α-變形菌
α-變形菌(Alphaproteobacteria)是變形菌門(Proteobacteria)下的一個纲[3]。此綱的成員變異性極大,且共通點極少,但他們確實系出同源。α-變形菌大多都是革兰氏阴性菌,而有些包內寄生的物種缺少肽聚醣,而造成革蘭氏染色變異。[3][4]
α-变形菌纲 | |
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穿透式電子顯微鏡下的昆蟲細胞,細胞被沃爾巴克體(Wolbachia)感染 授權:Public Library of Science / Scott O'Neill | |
科学分类 | |
界: | 原核生物界 Bacteria |
门: | 變形菌門 Proteobacteria |
纲: | α-变形菌纲 Alphaproteobacteria |
亞綱 | |
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特性
α-變形菌包含多種細菌,其中包含光自營細菌、植物共生菌(如根瘤菌)、內共生細菌(如Wolbachia),和胞內寄生細菌(如立克次體)。
此外,本綱還包含已滅絕的Proto-mitochondrion。真核生物的祖先攝入了此種細菌,進行內共生作用,成為後來的粒線體[2]。還有一種生物技術上很喜歡使用的農桿菌(Rhizobium radiobacter)也是本綱成員,科學家常常使用本物種來將外來DNA導入植物基因體中。[5]另外,一些光自營生物像是遍在遠洋桿菌(Pelagibacter ubique)也屬於此綱,α-變形菌的微生物可能佔了海洋微生物的10%左右。
演化及基因體
關於本綱所屬的目,有人反對現行的分類法,尤其是Pelagibacterales的地位,但大體上大家還是普遍接受。細菌的分類學一直是分類學家相當頭痛的問題,因為細菌的基因會彼此互相交流,且基因歧異度相當高(像是遍在遠洋桿菌由於他的寄生行為,就會精簡化他的基因體)。在某些目中,其成員的GC含量變異也大的誇張[2]。舉個例子,像是Pelagibacterales、立克次體目(Rickettsiales)和Holosporales三者的基因體都含有高AT含量,有人認為那其實是趨同演化所導致的假象[6][7][8],而反對方也有他們自己的論述[2][9][10][11]。後來有人發現用以判斷分類依據的rRNA中,GC含量好像好像不太會受基因體變異影響。因此,rRNA中GC含量較高的 Holosporales 就被和低GC含量的Pelagibacterales和立克次體目分開了[2]。
α-變形菌綱下有三個亞綱Magnetococcidae、立克次體亞綱(Rickettsidae)和柄桿菌亞綱(Caulobacteridae)[2]。基群為Magnetococcidae,此類別包含了許多趋磁细菌(由於趨磁細菌為多系群,因此只有部分包含於α-變形菌之下)[12]立克次體亞綱則由細胞內寄生的立克次體目(Rickettsiales),以及可以在胞外單獨生存的Pelagibacterales。柄桿菌亞綱則由Holosporales、紅螺旋菌目(Rhodospirillales)、鞘脂單胞菌目(Sphingomonadales)、紅細菌目( Rhodobacterales)、柄桿菌目(Caulobacterales)、Kiloniellales、Kordiimonadales、短小盒菌目(Parvularculales),和Sneathiellales。
系統發生學
以下表格是根據美国国家生物技术信息中心(NCBI)[4][13] 而樹狀圖則是根據'The All-Species Living Tree' Project所提供的16s rRNA分析結果[14]
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- 註:
資料取自美国国家生物技术信息中心(NCBI)
參考文獻
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(帮助)
外部連結
- MeSH(醫學主題詞)上面的Alphaproteobacteria(美式英语)
- Bacterial (Prokaryotic) Phylogeny Webpage: Alpha Proteobacteria. 页面存档备份,存于