洪金元，本籍福州閩縣，清朝官員。
洪金元於道光三十年（1850年）上任淡水廳大甲中軍守備，為台灣清治時期的地方官員，該官職主要從事大甲地區武職事務，品等不高，只為正七品以下，洪金元日後於咸豐十一年又再度回任斯職。