澎湖郡為台灣日治時期的行政區劃之一。該郡隸屬高雄州。
澎湖郡役所設於馬公街。澎湖郡管轄馬公街、湖西、白沙、西嶼、望安。澎湖郡轄域即今澎湖縣全境。
大正15年(1926年)澎湖郡脫離高雄州,獨立設置澎湖廳(府令第45號)。