结构模体
结构模体(英語:,亦称为结构基序)是链状生物分子(如蛋白质或核酸)中的一种超二级结构,也存在于其它分子之中。结构模体使得我们无法预测蛋白的生物学功能:不同蛋白质或酶中的相同模体可能存在较大功能差异。
因为一级结构和三级结构之间的关系并不简单直接,两个生物聚合物可以共享同一个模体又缺乏明显的一级结构的相似性。换言之,一个结构模体不必要具有与一个序列模体相关。另外,序列模体的存在并不一定意味着一个独特的结构。例如,在大多数DNA模体中,假设该序列的DNA不从正常的“双螺旋”结构偏离。
另见
- 模体结构域
- 序列模体
参考文献
- PROSITE Database of protein families and domains 页面存档备份,存于
- SCOP Structural classification of Proteins
- CATH Class Architecture Topology Homology 页面存档备份,存于
- FSSP FSSP 页面存档备份,存于
- PASS2 PASS2 - Protein Alignments as Structural Superfamilies
- SMoS SMoS - Database of Structural Motifs of Superfamily 页面存档备份,存于
- S4 S4: Server for Super-Secondary Structure Motif Mining
外部链接
- Chiang YS, Gelfand TI, Kister AE, Gelfand IM. . Proteins. 2007, 68 (4): 915–921. PMID 17557333. doi:10.1002/prot.21473.
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