金山园区站

金山园区站站房为侧式站房，面积2000平方米。站房设有一座候车室、一个售票厅，但售票系统设在候车室内而不在预定的售票厅内；进站口设在车站正门，进站后即是安检处，旅客需接受安检才能被允许进站；安检左侧是候车处、卫生间和实际上的售票处，设有两台自动售票机。服务中心设在候车室中央，提供交通卡充值、问询等服务[4]。进出站闸机则各设在问讯处两侧。

车站设有两座岛式月台，四个站台号：目前使用2、3站台，需要站台在站房内南侧的地下通道进入。

候车室

候车室内等候区

进出站地道

金山园区站有5条股道，均为金山城际铁路所用。其中3条为侧线，目前使用其中的两条；中间设有2条正线，系金山正线。另外在一站台预留一条侧线。