鯊齒龍科

在1931年，恩斯特·斯特莫建立鯊齒龍科，以包含新發現的撒哈拉鯊齒龍（Carcharodontosaurus saharicus）。在1995年，撒哈拉鯊齒龍的近親南方巨獸龍被敘述、命名，並被歸類於這個科。另外，許多古生物學家將高棘龍包含在此科內（Sereno等人 1996, Harris 1998, Holtz 2000, Rauhut 2003），而其他人則將高棘龍分類於相近的異特龍科（Currie & Carpenter, 2000; Coria & Currie, 2002, Eddy & Clarke, 2011, Rauhut 2011）。

當2006年發現馬普龍時，羅多爾夫·科里亞（Rodolfo Coria）與菲力·柯爾（Phil Currie）建立南方巨獸龍亞科，以包含更先進的南美洲物種，這些物種彼此關係更為接近，而離非洲與歐洲物種較遠。科里亞與柯爾並未將魁紂龍歸類於此亞科，需要更詳細的敘述，但根據牠們的股骨特徵，牠們可能也屬於南方巨獸龍亞科[7]。

高棘龍的骨架模型

在1998年，保羅·塞里諾（Paul Sereno）將鯊齒龍科定義為一個演化支，包含：撒哈拉鯊齒龍、與親緣關係接近鯊齒龍，而離脆弱異特龍、董氏中華盜龍、單脊龍、冰脊龍較遠的所有物種。因此，這個演化支不屬於異特龍科。

以下演化樹是根據布魯薩特等人的2009年研究[3]。但是，其中的新獵龍已被歸類於新獵龍科，已不屬於鯊齒龍科[8]：

以下演化樹則是F. Ortega等人在2010年提出的版本[9]︰

高棘龍分類位置仍未確定，大部分研究人員將牠們分類於鯊齒龍科[10]，而其他人則分類於異特龍科。在2011年的克拉瑪依龍重新研究，發現克拉瑪依龍屬於鯊齒龍科。根據堅尾龍類的種系發生學研究，發現克拉瑪依龍是種基礎鯊齒龍科恐龍，而始鯊齒龍也是種原始鯊齒龍科[11]。巴哈利亞龍也曾被假設為鯊齒龍科，但牠們的化石太少而不能確定。巴哈利亞龍似乎是角鼻龍下目三角洲奔龍的一個異名。

鯊齒龍科曾認為與阿貝力龍科有較接近親緣關係，而離異特龍科較遠。這是因為這兩個演化支有某些共同的頭蓋骨特徵。然而，這些相似處似乎是兩個演化支的平行演化而來的。有眾多的頭蓋骨與顱後特徵，支持鯊齒龍科與異特龍科之間有接近親緣關係。