Z-DNA

Z-DNA又稱Z型DNA，是DNA雙螺旋結構的一種形式，具有左旋型態的雙股螺旋（與常見的B-DNA相反），並呈現鋸齒形狀。Z-DNA為三種具生物活性的DNA雙螺旋結構之一，另兩種為A-DNA與B-DNA。

Z-DNA結構。

歷史

Z-DNA為首先於1979年被解出晶體結構的DNA型態，研究者為麻省理工大學的Alexander Rich等人[1]。B型及Z型相互結合時的結晶則解於2005年[2]，使科學家了解Z-DNA在細胞中的潛在角色，當一段Z-DNA形成時，其兩端必為B-Z相互結合型態，形成與B-DNA的介面。

B-DNA（深藍色）與Z-DNA（深紅色）相互結合型態，以及Z-DNA結合區塊（綠色），可見其兩個的突出的鹼基（中央的淡藍色及淡紅色）。來自PDB 2ACJ。

Z-DNA的雙股螺旋為左旋型態，與B-DNA的右旋型態明顯有所差別。其結構每兩個鹼基對重複出現一次。大小螺旋凹槽之間的差別較A型及B型小，只在寬度上有些微差異。這種型態並不常見，但某些特定情況可增加其存在的可能，如嘌呤-嘧啶交替序列、DNA超螺旋，或鹽份與某些陽離子濃度高時。

Z-DNA能夠與B-DNA構成相互結合型態，這種結構會使一對鹼基突出於雙螺旋之外。

A-, B-, 與 Z-DNA的側視圖.

A-, B-, 與 Z-DNA的螺旋軸.

幾何屬性	A-DNA	B-DNA	Z-DNA
螺旋方向	右旋	右旋	左旋
重複單元	1 bp	1 bp	2 bp
Rotation/bp	32.7°	35.9°	60°/2
bp/turn	11	10.5	12
Inclination of bp to axis	+19°	−1.2°	−9°
Rise/bp along axis	2.3 Å (0.23 nm)	3.32 Å (0.332 nm)	3.8 Å (0.38 nm)
Pitch/turn of helix	28.2 Å (2.82 nm)	33.2 Å (3.32 nm)	45.6 Å (4.56 nm)
Mean propeller twist	+18°	+16°	0°
糖基角度	anti	anti	C: anti, G: syn
Sugar pucker	C3'-endo	C2'-endo	C: C2'-endo, G: C3'-endo
直徑	23 Å (2.3 nm)	20 Å (2.0 nm)	18 Å (1.8 nm)
來源:[3][4][5]

Wang AHJ, Quigley GJ, Kolpak FJ, Crawford JL, van Boom JH, Van der Marel G, Rich A. . Nature (London). 1979, 282: 680–686. PMID 514347
Ha SC, Lowenhaupt K, Rich A, Kim YG, Kim KK. . Nature. 2005, 437: 1183–1186. PMID 16237447.
Sinden, Richard R. 1st. Academic Press. 1994-01-15: 398. ISBN 0-126-45750-6.
Rich A, Norheim A, Wang AHJ. . Annual Review of Biochemistry. 1984, 53 (1): 791–846. PMID 6383204. doi:10.1146/annurev.bi.53.070184.004043.
Ho PS. . Proc Natl Acad Sci USA. 1994-09-27, 91 (20): 9549–9553. Bibcode:1994PNAS...91.9549H. PMC 44850. PMID 7937803. doi:10.1073/pnas.91.20.9549.

Sinden RR (1994). DNA structure and function. Academic Press, 179-216. ISBN 978-0-12-645750-6
Rich A, Zhang S (2003). Timeline: Z-DNA: the long road to biological function. Nat Rev Genet, 4:566–572.

This article is issued from Wikipedia. The text is licensed under Creative Commons - Attribution - Sharealike. Additional terms may apply for the media files.