中华根瘤菌属

剑菌属（学名：Ensifer）是根瘤菌目根瘤菌科下的一属。中华根瘤菌属（学名：Sinorhizobium）是剑菌属的同属异名。中华根瘤菌属中的草木樨中华根瘤菌（Sinorhizobium meliloti）[4][5]与苜蓿中华根瘤菌（Sinorhizobium medicae）[6]进行过测序。

剑菌属/中华根瘤菌属
费氏中华根瘤菌USDA257
科学分类
界： 原核生物界 Bacteria
门： 變形菌門 Proteobacteria
纲： α-变形菌纲 Alphaproteobacteria
目： 根瘤菌目 Rhizobiales
科： 根瘤菌科 Rhizobiaceae
属： 剑菌属 Ensifer
Casida, 1982
模式种
剑菌属的模式种为附着剑菌 Ensifer adhaerensCasida, 1982


中华根瘤菌属的模式种为费氏中华根瘤菌 Sinorhizobium fredii (Scholla and Elkan 1984) Chen et al. 1988

物种[1][2][3]

见内文

異名

中华根瘤菌属 SinorhizobiumChen et al. 1988

名称

该属曾先后于1982年与1988年被命名为剑菌属（Ensifer）与中华根瘤菌属（Sinorhizobium）。根据国际原核微生物系统学委员会（International Committee on Systematics of Prokaryotes，ISCP）的《细菌学法规》（Bacteriological Code）规定，发表时间更早的名称有优先命名权。[7]由于有人提议将当时剑菌属的唯一物种附着剑菌（Ensifer adhaerens）并入中华根瘤菌属，为此ISCP设立了一个专门分委会对此进行评估。最终剑菌属保留其名称，并将所有中华根瘤菌属的物种并入剑菌属之中。[8][9]虽然如此，在大多学术著作中还是同时延用了这两个名称，而中华根瘤菌属一名则更为常见。

分类
  • Sinorhizobium abri Ogasawara et all. 2003[10][11]
  • 附着剑菌（Ensifer adhaerens Casida 1982[12]）
  • 美洲中华根瘤菌（Sinorhizobium americanum corrig. Toledo et al. 2003[13]）
  • 木本树中华根瘤菌（Sinorhizobium arboris Nick et al. 1999[14]）
  • Sinorhizobium chiapanecum Rincón-Rosales et al. 2009[15]
  • 费氏中华根瘤菌（Sinorhizobium fredii Scholla and Elkan 1984 emend. De Lajudie et al. 1994[16]）
  • Ensifer garamanticus Merabet et al. 2010[17]
  • Sinorhizobium indiaense Ogasawara et all. 2003[10][11]
  • 柯斯第中华根瘤菌（Sinorhizobium kostiense Nick et al. 1999[14]
  • 鸡眼草中华根瘤菌（Sinorhizobium kummerowiae Wei et al. 2002[18]）
  • 苜蓿中华根瘤菌（Sinorhizobium medicae Rome et al. 1996[19]）
  • 草木樨中华根瘤菌（Sinorhizobium meliloti (Dangeard 1926) De Lajudie et al. 1994[20]）
  • 墨西哥剑菌（Ensifer mexicanus Lloret et al. 2007[21]）
  • 努米底亚剑菌（Ensifer numidicus Merabet et al. 2010[17]）
  • 萨赫靳中华根瘤菌（Sinorhizobium saheli De Lajudie et al. 1994[20]）
  • 菽剑菌（Ensifer sojae Li et al. 2010[22]）
  • 好客中华根瘤菌（Sinorhizobium terangae corrig. De Lajudie et al. 1994[20]）

参考文献
  1. . [2011-11-05]. （原始内容存档于2012-03-19）.
  2. . [2011-11-05]. （原始内容存档于2012-03-19）.
  3. Garrity, George M.; Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T. (eds.). . New York, New York: Springer. 2005: 354–361. ISBN 978-0-387-24145-6.
  4. Galibert, F.; 等. . Science. 2001, 293 (5530): 668–672 [2011-11-05]. PMID 11474104. doi:10.1126/science.1060966. （原始内容存档于2008-06-21）.
  5. NCBI Genome Page for Sinorhizobium meliloti
  6. NCBI Genome Page for Sinorhizobium medicae
  7. Young, J. M. . Int J Syst Bacteriol. 2003, 53 (6): 2107–2110 [2011-11-05]. doi:10.1099/ijs.0.02665-0. （原始内容存档于2009-02-11）.
  8. Lindström, K., and Martinez-Romero, M. E. (PDF). Int J Syst Bacteriol. 2002, 52 (6): 2337 [2011-11-05]. （原始内容 (PDF)存档于2007-09-29）.
  9. Judicial Commission of the International Committee on Systematics of Prokaryotes. . Int J Syst Bacteriol. 2008, 58 (Pt 8): 1973. PMID 18676490. doi:10.1099/ijs.0.2008/005991-0.
  10. Ogasawara, M., Suzuki, T., Mutoh, I., Annapurna, K., Arora, N. K., Nishimura, Y., and Maheshwari, D. K. . Symbiosis. 2003, 34 (1): 53–68.
  11. Because no type strains have been submitted to international culture collections, these are not currently recognized as valid species.
  12. L. E. Casida, Jr. . Int J Syst Bacteriol. 1982, 32 (3): 339–345. doi:10.1099/00207713-32-3-339.
  13. Toledo, I., Lloret, L., and Martínez-Romero, E. . Syst Appl Microbiol. 2003, 26 (1): 54–64 [2011-11-05]. PMID 12747410. doi:10.1078/072320203322337317. （原始内容存档于2019-02-19）.
  14. Nick, G., de Lajudie, P., Eardly, B. D., Suomalainen, S., Paulin, L., Zhang, X., Gillis, M., and Lindström, K. . Int J Syst Bacteriol. 1999, 49 (Pt. 4): 1359–1368 [2011-11-05]. PMID 10555313. doi:10.1099/00207713-49-4-1359. （原始内容存档于2008-07-06）.
  15. Reiner Rincón-Rosales, Lourdes Lloret, Edith Ponce, and Esperanza Martínez-Romero. . Syst Appl Microbiol. 2009, 67 (1): 103–117. PMC 2784085. PMID 19120461. doi:10.1111/j.1574-6941.2008.00590.x.
  16. Chen, W. X., Yan, G. H., and Li, J. L. . Int J Syst Bacteriol. 1988, 38 (4): 392–397. doi:10.1099/00207713-38-4-392.
  17. C. Merabet, M. Martens, M. Mahdhi, F. Zakhia, A. Sy, C. Le Roux, O. Domergue, R. Coopman, A. Bekki, M. Mars, A. Willems and P. de Lajudie. (PDF). Int J Syst Evol Microbiol. 2009,. (Epub ahead of print) (Pt 3): 1–33. PMID 19656922. doi:10.1099/ijs.0.012088-0.
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  21. Lloret, L., Ormeño-Orrillo, E., Rincón, R., Martínez-Romero, J., Rogel-Hernández, M. A., and Martínez-Romero, E. . FEMS Microbiology Ecology. 2007, 30 (4): 280–290 [2011-11-05]. PMID 17293074. doi:10.1016/j.syapm.2006.12.002. （原始内容存档于2019-02-19）.
  22. Li, Q. Q, Tao Wang, E. T., Chang, Y. L., Zhang, Y. Z., Zhang, Y. M., Sui, X. H., Chen, W. F., and Chen, W. X. . Int J Syst Evol Microbiol. 2010, 49: 1359–1368. PMID 20851917. doi:10.1099/ijs.0.025049-0.
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