基础体温

在月經週期中的卵泡期，雌激素提高，使基础体温降低。排卵後因黄体產生的孕酮，會使基础体温升高。基础体温的升高一般在排卵後一天最明顯，不過也有變異，因此用基础体温判斷排卵期會有三天的誤差[5]。

若沒有懷孕，黄体的解體會導致基础体温下降，約和下次月經來臨時間一致，若有懷孕，黄体會繼續作用，因此在懷孕前三個月會維持較高的基础体温，在三個月以後胎盤接管原來由黄体進行的機能，因此基础体温會降低到卵泡期的溫度。

一些少見的情形下，黄体會形成囊腫，黄体囊腫會使基础体温維持在較高的溫度，而且不會有月經，一直到黄体囊腫消失為止，過程可能需要幾週到數個月。

規則的月經週期是女性正常排卵的證據之一，若月經週期不規則，也表示可能沒有正常排卵。不過許多女性月經週期不規則，可是也正常排卵，有些月經週期規則的女性可能沒有無排卵，或是黃體期異常。基础体温的記錄可以準確的判斷是否有排卵，也可以判斷黃體期的長度足夠讓受精卵著床。有些生育力的軟體可以協助女性判斷上述的資訊。

妊娠試驗無法在排卵後的三週內檢測。知道預估的排卵日可以讓女性不要太早進行檢測，可能會得到偽陰性的錯誤結果。而且，若基础体温連續十八天上昇，幾乎可以確認女性已經懷孕[6]。

在估計胎兒的妊娠年齡時，追蹤基础体温比追蹤月經週期的結果要準確[7]。

月經週期

基础体温法是一些估算排卵期之自然避孕法的基礎，而且也可以推算何時是排卵期後的不孕期。不過基础体温法只能知道現在是否有排卵，無法預測排卵期。而一般精子的壽命約有七至十日[8]，因此需預測性交後的七至十天內是否都不會排卵，以避免懷孕。