大石站

大石站共设有两层，地面为新光快速路、群贤路、地铁大石公交车站以及其它建筑，地下一層為站廳，以及车站北端预留部分结构；地下二層為3號線站台層。

地下 一層	站廳	售票機、客服中心、商店、警务室、安检设施
		北端预留部分[註 1]
地下 二層		2站台 3号线 机场北 / 天河客運站方向（廈滘站）
	島式站台
		1站台 3号线 番禺广场方向（漢溪長隆站）

站厅（北侧付费区内）

站台北端前往预留月台的扶手电梯

为方便乘客进出，大石站站厅付费区设于站厅北侧以及站厅东侧，周围被行人通道以及车站商店包围，站厅付费区内设有五条扶手电梯、一台专用电梯（升降机）以及一组楼梯供乘客往返于月台。

另外，大石站在站厅北端预留了侧式站台的部分结构，供当时的7号线使用，但后来规划的7号线改至汉溪长隆站与3号线交汇，该结构现时用车站搪瓷版封闭。

大石站現時设有麵包糕餅店以及鸭脖店等。此外本站亦设有自動售賣機、自动售卡/充值机以及“好易”自助机。

大石站設有一個島式月台，位於新光快速路地下。

本站南面設有一組雙存車線。現時會用於停放備用車，並在晚高峰期間向北開出疏導客流。該組存車線亦會用於折返短線（小交路）列車。短線班次列車在1號月台清客完成後，便會進入該組存車線，折返到2號月台上客往天河客運站，或退出服務并返回廈滘車輛段。

另外，在本站北面亦同时设有一条单渡线，该渡线可供3号线收车前番禺广场方向的不載客列车站前折返進入2号月台后，返回厦滘车辆段。

當3號綫汉溪长隆至番禺广场段出現故障時，往番禺广场站的列車將會通過上述渡线或雙存車線折返，以本站為臨時總站。

1号月台全景图（摄于2017年10月）

B出入口

大石站现时设有3个出入口供乘客进出。B出入口因出入口外部施工工程于2020年8月6日起暂时停用。

	編號	设施	出口指示	建議前往的目的地
	A		群贤路	大石家私城、新光快速路、地铁大石站公交总站
	B			（暂停使用）
	C		新光快速路	植村、地铁大石站公交车站
	D		新光快速路	新光快速路、群贤路、永佳丰田全国金牌店
	註︰ 設有 |  設有 |  設有輪椅升降台 |  設有扶手電梯

2018年7月18日晚，一名身穿无袖“洛丽塔”服飾的大学生准备从大石站进站乘搭地铁时，被出入口旁的安检人员以“奇装异服”为由拒绝进站乘车。事發後，事主第一時間發微博。后来广州地铁官方在兩日之後表态对该名乘客致深表歉意，并表示要求安检公司加强全体安检员的规章制度和服务技能培训，避免同类事情再次发生。如果打扮过于骇人，工作人员还是会有权拒绝其进站乘车[2][3]。