孢子絲菌屬

孢子絲菌病最早的病例為1898年，約翰霍普金斯大學的醫學生班傑明‧申克（）從一名病人手指的潰傷中取樣本進行培養，並將長出的真菌送交專家鑑定[9]，認為可能屬於側孢黴屬（Sporotrichum）[10]。1900年，數名芝加哥的醫師報導了孢子絲菌病的第二例病例，並進而描述發表了本屬與其模式種申克氏孢子絲菌，但未提供具體的屬級特徵，因此一度被視為無效名，直到1960年代，有分類學家指出申克氏孢子絲菌與側孢黴屬的模式種黃金側孢黴（Sporotrichum aureum）外形相差甚遠（後者後來被歸入擔子菌門），而又將其歸入孢子絲菌屬（Sporothrix），並漸為學界所接受[10]。

長久以來造成孢子絲菌病的病原真菌都被認為是申克氏孢子絲菌單一種。2003年，de Beer等人以核糖體DNA序列分析顯示申克氏孢子絲菌包含兩大類群，分別是從病人傷口分離的菌株與從土壤、植物材料中分離的菌株[11][12]^:395。2006年，Marimon等人以其他基因序列分析顯示申克氏孢子絲菌包含三個主要的演化支[13]，並於隔年將其拆分為巴西孢子丝菌、球形孢子丝菌與墨西哥孢子丝菌等新種，其中巴西孢子絲菌為巴西的菌株，球形孢子丝菌包含歐洲、亞洲與美洲等地的菌株，墨西哥孢子絲菌為墨西哥的菌株，拆分後的申克氏孢子絲菌則為美洲其他地區的菌株[5]。後續有許多研究以其他基因序列進行分析，結果亦支持拆分[14]。申克氏孢子絲菌原有一變種盧艾里孢子絲菌（S. schenckii var. luriei），發表於1969年，是1956年由一南非病患傷口中分離的菌株。2008年，Marimon等人以基因序列分析顯示其為巴西孢子丝菌、球形孢子丝菌和申克氏孢子絲菌組成的演化支之姊妹群，而將其獨立為一新種[12]^:396[15]。申克氏孢子絲菌、巴西孢子絲菌、球形孢子絲菌與盧艾里孢子絲菌等本屬致病的物種共同組成一單系群，而墨西哥孢子絲菌的致病能力較低，只造成過零星感染個案，其親緣關係也與前述四種致病菌較遠[14]。

除了致病真菌外，孢子絲菌屬亦有許多生長在土壤與植物材料中、不感染動物的物種，許多物種曾被當作長喙殼菌屬物種的無性型[註 1][17]。1974年，荷蘭真菌學家De Hoog發表的專論中列出了本屬共24種物種，其中便有13種為長喙殼菌屬的無性型，而申克氏孢子絲菌也被視為Ophiostoma stenoceras的無性型[10][16]。

過去關於孢子絲菌屬真菌的分類研究多只著重於致病物種或環境物種兩者之一，少有將兩者合併討論者[14]。