已测序真核生物基因组列表

已测序真核生物基因组列表包括所有已知的，可以公开获取已组装、注释和发表的细胞核和细胞器基因组序列的真核生物；基因组草图不包括在内，只有细胞器序列的物种也不包括。

酿酒酵母是确定其完整基因组序列的第一个真核生物。

1977年，第一次出现DNA测序。1995年，细菌流感嗜血杆菌第一个完成了全基因组序列。1996年，酿酒酵母是第一个发布的真核生物基因组序列。1998年，发布了第一个多细胞真核生物基因组序列，秀丽隐杆线虫。

原生生物

以下是最早的5個完成基因組測序的原生生物。更完整的列表，請參閱已測序原生生物基因組列表。

植物

以下是最早的5个完成基因组测序的植物，更完整的列表，请参阅已测序植物基因组列表

物种学名	类型	关联	基因组大小	预测的基因数	机构	完成年份
Arabidopsis thaliana 生态型:哥伦比亚	拟南芥	模式植物	119 Mb	25,498,[1] 27,400,[2] 31,670 (UniProt)	Arabidopsis Genome Initiative[3]	2000[1]
Cyanidioschyzon merolae Strain:10D	红藻	单细胞真核生物	16.5 Mb	5,331[4]	University of Tokyo, Rikkyo University, Saitama University and Kumamoto University	2004[4]
Oryza sativassp ssp indica	大米	Crop and model organism	420 Mb	32-50,000[5]	Beijing Genomics Institute、浙江大学、中国科学院	2002[5]
Ostreococcus tauri	绿藻	单细胞真核生物，基因组较小	12.6 Mb	7,969 (UniProt)	Laboratoire Arago	2006[6]
Populus trichocarpa	Balsam poplar or Black Cottonwood	固碳模式植物，商业木材and comparison to A. thaliana	550 Mb	45,555[7]	The International Poplar Genome Consortium	2006[7]

真菌

以下是最早的5个完成基因组测序的真菌，更完整的列表，请参阅已测序真菌基因组列表。

物种	纲	意义	基因组大小	预测基因数目	完成机构	完成年份
釀酒酵母 Saccharomyces cerevisiae 品系：S288C	酵母菌綱	用于酿造啤酒的酵母；常用的模式生物	12.1 Mb	6,294[8]	大规模国际合作项目[9]	1996[8]
家兔脑胞内原虫 Encephalitozoon cuniculi	微孢子蟲纲	人类病原体	2.9 Mb	1,997[10]	Genoscope和Université Blaise Pascal	2001[10]
粟酒裂殖酵母 Schizosaccharomyces pombe 品系：972h-	裂殖酵母纲	模式生物	14 Mb	4,824[11]	桑格研究所和冷泉港實驗室	2002[11]
粉色麵包黴菌 Neurospora crassa	糞殼菌綱	模式生物	40 Mb	10,082[12]	Broad Institute、俄勒岡健康與科學大學、肯塔基大学和堪萨斯大学	2003[12]
黄孢原毛平革菌 Phanerochaete chrysosporium 品系：RP78	傘菌綱	木材腐朽真菌；常用于真菌修復	30Mb	11,777[13]	Joint Genome Institute	2004[13]

动物

以下是最早的5个完成基因组测序的动物，更完整的列表，请参阅已测序动物基因组列表。

参见

基因组
人类基因组计划
遗传学
已测序的生物
已测序古菌基因组列表
已测序细菌基因组列表
已测序质体基因组列表

参考资料

The Arabidopsis Genome Initiative,. . Nature. December 2000, 408 (6814): 796–815. PMID 11130711. doi:10.1038/35048692.
Ensembl entry
Arabidopsis Genome Initiative 的存檔，存档日期2006-02-07.
Matsuzaki M; Misumi O; Shin-I T; 等. . Nature. April 2004, 428 (6983): 653–7. Bibcode:2004Natur.428..653M. PMID 15071595. doi:10.1038/nature02398. 已忽略未知参数|author-separator= (帮助)
Goff SA; Ricke D; Lan TH; 等. . Science. April 2002, 296 (5565): 92–100. Bibcode:2002Sci...296...92G. PMID 11935018. doi:10.1126/science.1068275. 已忽略未知参数|author-separator= (帮助)
Derelle E; Ferraz C; Rombauts S; 等. . PNAS. August 2006, 103 (31): 11647–52. Bibcode:2006PNAS..10311647D. PMC 1544224. PMID 16868079. doi:10.1073/pnas.0604795103. 已忽略未知参数|author-separator= (帮助)
Tuskan GA, Difazio S, Jansson S; 等. . Science. September 2006, 313 (5793): 1596–604. Bibcode:2006Sci...313.1596T. PMID 16973872. doi:10.1126/science.1128691.
Goffeau A, Barrell BG, Bussey H, 等. . Science. October 1996, 274 (5287): 546, 563–7. Bibcode:1996Sci...274..546G. PMID 8849441. doi:10.1126/science.274.5287.546.
International Collaboration for the Yeast Genome Sequencing 的存檔，存档日期2007-09-27.
Katinka MD, Duprat S, Cornillot E, 等. . Nature. November 2001, 414 (6862): 450–3. PMID 11719806. doi:10.1038/35106579.
Wood V, Gwilliam R, Rajandream MA, 等. . Nature. February 2002, 415 (6874): 871–80. PMID 11859360. doi:10.1038/nature724.
Galagan JE, Calvo SE, Borkovich KA, 等. . Nature. April 2003, 422 (6934): 859–68. Bibcode:2003Natur.422..859G. PMID 12712197. doi:10.1038/nature01554.
Martinez, Diego; Larrondo, Luis F; Putnam, Nik; Gelpke, Maarten D Sollewijn; Huang, Katherine; Chapman, Jarrod; Helfenbein, Kevin G; Ramaiya, Preethi; 等. . Nature Biotechnology. 2004, 22 (6): 695–700. PMID 15122302. doi:10.1038/nbt967.

外部链接

Diark - a resource for eukaryotic genome research
EMBL-EBL Eukaryotic Genomes
UCSC Genome Browser
International Sequencing Consortium - Large-scale Sequencing Project Database
Ensembl The Ensembl Genome Browser (includes draft and low coverage genomes)
Fungal Genome Initiative (includes draft genomes)
GOLD:Genomes OnLine Database v 3.0
SUPERFAMILY comparative genomics database Includes genomes of all completely sequenced eukaryotes, and sophisticated datamining plus visualisation tools for analysis
Rat Genome Database

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[Arab-1] The Arabidopsis Genome Initiative,. . Nature. December 2000, 408 (6814): 796–815. PMID 11130711. doi:10.1038/35048692.

[2] Ensembl entry

[3] Arabidopsis Genome Initiative 的存檔，存档日期2006-02-07.

[Matsuzaki-4] Matsuzaki M; Misumi O; Shin-I T; 等. . Nature. April 2004, 428 (6983): 653–7. Bibcode:2004Natur.428..653M. PMID 15071595. doi:10.1038/nature02398. 已忽略未知参数|author-separator= (帮助)

[Goff-5] Goff SA; Ricke D; Lan TH; 等. . Science. April 2002, 296 (5565): 92–100. Bibcode:2002Sci...296...92G. PMID 11935018. doi:10.1126/science.1068275. 已忽略未知参数|author-separator= (帮助)

[6] Derelle E; Ferraz C; Rombauts S; 等. . PNAS. August 2006, 103 (31): 11647–52. Bibcode:2006PNAS..10311647D. PMC 1544224. PMID 16868079. doi:10.1073/pnas.0604795103. 已忽略未知参数|author-separator= (帮助)

[Tuskan-7] Tuskan GA, Difazio S, Jansson S; 等. . Science. September 2006, 313 (5793): 1596–604. Bibcode:2006Sci...313.1596T. PMID 16973872. doi:10.1126/science.1128691.

[Goffeau-8] Goffeau A, Barrell BG, Bussey H, 等. . Science. October 1996, 274 (5287): 546, 563–7. Bibcode:1996Sci...274..546G. PMID 8849441. doi:10.1126/science.274.5287.546.

[9] International Collaboration for the Yeast Genome Sequencing 的存檔，存档日期2007-09-27.

[Katinka-10] Katinka MD, Duprat S, Cornillot E, 等. . Nature. November 2001, 414 (6862): 450–3. PMID 11719806. doi:10.1038/35106579.

[Wood-11] Wood V, Gwilliam R, Rajandream MA, 等. . Nature. February 2002, 415 (6874): 871–80. PMID 11859360. doi:10.1038/nature724.

[Galagan-12] Galagan JE, Calvo SE, Borkovich KA, 等. . Nature. April 2003, 422 (6934): 859–68. Bibcode:2003Natur.422..859G. PMID 12712197. doi:10.1038/nature01554.

[martinez-13] Martinez, Diego; Larrondo, Luis F; Putnam, Nik; Gelpke, Maarten D Sollewijn; Huang, Katherine; Chapman, Jarrod; Helfenbein, Kevin G; Ramaiya, Preethi; 等. . Nature Biotechnology. 2004, 22 (6): 695–700. PMID 15122302. doi:10.1038/nbt967.