抗菌肽

抗菌肽（Cathelicidin），係一系列可在巨噬細胞和中性粒細胞的溶酶體中找到的具有抗菌作用的多肽[1]。這種多肽在哺乳動物對侵襲性細菌感染的先天免疫中扮演着重要的角色[2]。抗菌肽家族被歸爲抗微生物肽（antimicrobial peptides ，縮寫爲AMPs）的一種。防禦素則是抗微生物肽家族的另一成員。儘管抗菌肽家族與防禦素具有相同的結構特徵，但它們卻具有高度異質性[2]。

抗菌肽
Cathelicidin antimicrobial peptide
以蛋白質資料庫（PDB） 2FBS爲基礎的經渲染版本
有效结构
PDB 直系同源检索：PDBe, RCSB
标识
代号 CAMP; CAP-18; CAP18; CRAMP; FALL-39; FALL39; HSD26; LL37
扩展标识 遗传学：600474 鼠基因：108443 同源基因：110678 GeneCards: CAMP Gene
RNA表达模式
更多表达数据
直系同源体
物种 人类 小鼠
Entrez 820 12796
Ensembl ENSG00000164047 ENSMUSG00000038357
UniProt P49913 P51437
mRNA序列 NM_004345 NM_009921
蛋白序列 NP_004336 NP_034051
基因位置 Chr 3:
48.22 – 48.23 Mb		 Chr 9:
109.85 – 109.85 Mb
PubMed查询
  注意：本條目介紹的不是「抗微生物肽」（Antimicrobial peptides）

抗菌肽家族的成員可通過一個高度穩定的區域（即凱薩林域（cathelin domain））和另一個高度可變的域來表徵[2]。

哺乳動物的各個種的抗菌肽之間是互相孤立的。最初，科學家在中性粒細胞中發現了抗菌肽，不過，隨後，科學家發現，在經過細菌或病毒或骨化三醇（維生素D的活性形式）的刺激後，上皮細胞和巨噬細胞中亦會產生抗菌肽[3]。

特徵
抗菌肽
Cathelicidin
內源性抗微生物多肽的抗菌肽基序（the Cathelicidin Motif of Protegrins）的晶體結構分析
鑑定
標誌Cathelicidin
PfamPF00666
Pfam宗系CL0121
InterProIPR001894
PROSITEPDOC00729
 SCOP1lyp / SUPFAM
 OPM家族236
OPM蛋白2k6o

抗菌肽的長度範圍很大，其長度可從12個氨基酸殘基到80個氨基酸殘基。它們的結構也千變萬化[4]。大部分的抗菌肽均爲摺疊成兩親性的α螺旋的長爲23-37個氨基酸的線狀肽。不過也有小部分的抗菌肽長度在12-18個氨基酸之間。這類肽有一到兩個起穩定結構作用的二硫鍵，且擁有β髮夾結構。科學家也有發現長度較長的抗菌肽（長度在39-80個氨基酸殘基之間）。這些長度較長的抗菌肽呈現出重複的脯氨酸基序，形成了延長的聚脯氨酸型結構[2]。

抗菌肽與半胱氨酸蛋白酶抑製劑家族有着一級同源性[5]，儘管那些被認爲很重要的氨基酸殘基在這一蛋白酶抑制家族中往往難以找到。

種類

抗菌肽家族的成員在人類、猴子、小鼠、大鼠、豚鼠、熊貓、豬、牛、青蛙、綿羊、山羊、雞，還有馬體內都有分佈。

如今已被確認的抗菌肽有：[2]

  • 人類：hCAP-18/LL-37
  • 恆河猴：RL-37
  • 小鼠：CRAMP-1/2[6]
  • 大鼠：rCRAMP
  • 兔：CAP-18
  • 豚鼠：CAP-11
  • 豬：PR-39、Prophenin、PMAP-23/6/37
  • 牛：BMAP-27/28/34（牛髓細胞抗菌肽）、Bac5、Bac7
  • 青蛙：抗菌肽-AL（在棕點湍蛙（Amolops loloensis）體內存在）[7]
  • 羊：
  • 山羊：
  • 雞：fowlicidins 1/2/3以及抗菌肽β-1（cathelicidin Beta-1）[8]
  • 馬：
  • 熊貓：

臨床意義

患酒渣鼻的患者體內的抗菌肽水平和角質層胰蛋白酶酵素（SCTEs）水平會升高。在激肽釋放酶7（KLK7）和激肽釋放酶5（KLK5）的共同作用下，抗菌肽能被切割成抗微生物肽LL-37。LL-37過量被認爲是引發酒渣鼻（無論是其哪一亞種）的罪魁禍首之一[9]。抗生素已被用於酒渣鼻的治療，然而，抗生素之所以起作用，或許僅僅是因爲它部分抑制了角質層胰蛋白酶酵素[10]。

維生素D能提高的人體內抗菌肽hCAP18的水平，而hCAP18據信能有效降低接受透析的患者因感染而造成的死亡風險。拥有高水平hCAP18蛋白的患者经过一年透析之后能存活并免受致命感染的概率是一般患者的3.7倍。[11]。

維生素D能夠增強抗菌肽相關基因的表達，而抗菌肽又對細菌，真菌和病毒具有廣譜抗微生物活性[12][13]。抗菌肽能在巨噬細胞內的吞噬體與溶酶體融合後快速摧毀原來吞噬體裏的微生物的脂蛋白膜。

資料庫

針對抗菌胜肽，提供相關資訊的研究型資料庫，如:dbAMP 。 dbAMP 為一個綜合型抗菌胜肽資料庫，其中所包含的資訊有抗菌胜肽蛋白質序列、名稱、物種來源、抗菌物種分類、抗菌胜肽的物理性質、是否經實驗研究證明以及蛋白質結構分析與圖形化等資訊，此些資料庫同時也提供抗菌胜肽等預測工具，供使用者瀏覽、分析及研究應用。

參見

參考
  1. .
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拓展閱讀
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