生物病毒分类表

本頁面列出了生物病毒的分類,包含病毒以及類病毒普利昂蛋白衛星病毒等等得亞病毒因子

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被子植物APG分类法IIIIIIIV
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鸟类传统分类系统
鸟类DNA分类系统
哺乳动物分类表

由於病毒並不像其他生物能藉由交配產生後代,因此在種別的定義上與一般生物有所不同。

概论

ICTV分类法

國際病毒分類委員會(International Committee on Taxonomy of Viruses,簡稱ICTV)在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。其七届ICTV会议首次规范化了病毒物种的概念,即病毒分类的分支层次中的最低分类单元。[1]分類的主要依據是病毒顆粒的特性、抗原特性與生物特性。

到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究,从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的,而来自环境中(如海水、大洋沉积物等)的病毒样品则大部分的序列都是全新的。[2]

病毒分类从域开始,结构如下,分类后缀在括号中:[3]

Realm (-viria)
亚域 Subrealm (-vira)
Kingdom (-viriae)
亚界 Subkingdom (-virites)
Phylum (-viricota)
亚门 Subphylum (-viricotina)
Class (-viricetes)
亚纲 Subclass (-viricetidae)
Order (-virales)
亚目 Suborder (-virineae)
Family (-viridae)
亚科 Subfamily (-virinae)
Genus (-virus)
亚属 Subgenus (-virus)
Species

物种名称通常以[疾病]病毒的形式出现,尤其是高等动植物。 ICTV2019版分类表中总共有4个域, 9个界, 16个门, 2个亚门, 36个纲, 55个目, 8个亚目, 168个科, 103个亚科, 1421个属, 68个亚属, 6590个种。除亚域、亚界和亚纲外,其他级别的分类单元都被使用。共有4个域,1个地位未定目,24个地位未定科,3个地位未定属被承认[4]

巴尔的摩分类法

巴尔的摩分类法是基于病毒mRNA的合成方式。

诺贝尔奖获得者生物学家戴维·巴尔的摩在1970年代提出了巴尔的摩分类系统。[5]巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类。[6][7][8]

巴尔的摩分类法是基于病毒mRNA的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中,必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制,但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的RNA或DNA,可以有也可以没有反转录酶。而且,单链RNA病毒可以是正义(+)或反义(-)。这一分类法将病毒分为7类:

举一个病毒分类的例子:水痘病毒,即带状疱疹病毒,属于疱疹病毒目疱疹病毒科甲型疱疹病毒亚科水疱病毒属;同时,带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类,因为它是双链DNA病毒,且不含有反转录酶。

ICTV 2019版病毒分类表

國際病毒分類委員會(International Committee on Taxonomy of Viruses,簡稱ICTV)是国际微生物学联合会(International Union of microgical Societies)发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构。该系统与细胞生物分类系统有许多共同特征,如分类单元结构,但也存在一些差异,比如所有分类名称都使用斜体,这与国际藻类、真菌和植物命名法以及国际动物命名法不同。

雙鏈去氧核糖核酸病毒域 Duplodnaviria

  • 香港病毒界 Heunggongvirae 2 门
    • 衣壳病毒门 Peploviricota 1 纲
    • 尾噬菌体门 Uroviricota 1 纲
      • 有尾噬菌体纲 Caudoviricetes 1 目
        • 有尾噬菌体目 Caudovirales 9 科, 1 属
          • 埃凯曼病毒科 Ackermannviridae 2 亚科, 1 属, 2 种
          • 自复制短尾噬菌体科 Autographiviridae 9 亚科, 69 属
          • 蔡斯噬菌体科 Chaseviridae 6 属
          • 德默莱兹噬菌体科 Demerecviridae 3 亚科, 4 属
          • 德雷克斯勒噬菌体科 Drexlerviridae 4 亚科, 6 属
          • 代列尔噬菌体科 Herelleviridae 5 亚科, 3 种
          • 肌尾噬菌体科 Myoviridae 5 亚科, 121 属, 3 种
          • 短尾噬菌体科 Podoviridae 3 亚科, 37 属, 7 种
          • 长尾噬菌体科 Siphoviridae 13 亚科, 228 属, 1 种
          • 百合病毒属 Lilyvirus 1 种

單鏈去氧核糖核酸病毒域 Monodnaviria

包含4界

  • 洛布病毒界 Loebvirae 1 门
    • 霍夫奈病毒门 Hofneiviricota 1 纲
      • 纤维噬菌体纲 Faserviricetes 1 目
        • 微管噬菌体目 Tubulavirales 2 科
          • 丝状噬菌体科 Inoviridae 23 属
          • 短杆状噬菌体科 Plectroviridae 3 属
  • 桑格病毒界 Sangervirae 1 门
    • 菲克斯病毒门 Phixviricota 1 纲
      • 小噬菌体纲 Malgrandaviricetes 1 目
        • 微噬菌体目 Petitvirales 1 科
          • 微小噬菌体科 Microviridae 2 亚科
  • 称徳病毒界 Shotokuvirae 2 门
    • 科萨特病毒门 Cossaviricota 3 纲
      • 松弛病毒纲 Mouviricetes 1 目
        • 普林病毒目 Polivirales 1 科
          • 二分DNA病毒科 Bidnaviridae 1 属
      • 乳多空病毒纲 Papovaviricetes 2 目
        • SE多瘤病毒目 Sepolyvirales 1 科
        • 楚尔豪森病毒目 Zurhausenvirales 1 科
      • 第五病毒纲 Quintoviricetes 1 目
    • 单环编码病毒门 Cressdnaviricota 2 纲:编码复制相关蛋白的环状单链DNA病毒(Circular replication-associated protein-encoding single-stranded DNA viruses, CRESS DNA viruses)
      • 精氨酸指针病毒纲 Arfiviricetes 5 目
        • 硅藻病毒目 Baphyvirales 1 科
          • 硅藻DNA病毒科 Bacilladnaviridae 3 属
        • 圆环病毒目 Cirlivirales 1 科
          • 圆环病毒科 Circoviridae 2 属
        • CRESS亚基因组目 Cremevirales 1 科
          • 小环状DNA病毒科 Smacoviridae 6 属
        • 多基因病毒目 Mulpavirales 1 科
          • 矮缩病毒科 Nanoviridae 2 属, 1 种
        • 圆形CRESS病毒目 Recrevirales 1 科
          • 圆形病毒科 Redondoviridae 1 属
      • Rep单链编码病毒纲 Repensiviricetes 1 目
        • 基因植物真菌病毒目 Geplafuvirales 2 科
          • 双生病毒科 Geminiviridae 9 属, 2 种
          • 类双生病毒科 Genomoviridae 9 属
  • 特拉帕尼病毒界 Trapavirae 1 门
    • 嗜盐病毒门 Saleviricota 1 纲
      • 凌乱病毒纲 Huolimaviricetes 1 目
        • 盐藻病毒目 Haloruvirales 1 科
          • 嗜盐菌多形病毒科 Pleolipoviridae 3 属

核糖病毒域 Riboviria

包含2 界, 2 科, 4 属

  • 正RNA病毒界 Orthornavirae 5 门, 2 科, 1 属
    • 双链RNA病毒门 Duplornaviricota 3 纲
      • 克里莫提病毒纲 Chrymotiviricetes 1 目
        • 加布里埃尔病毒目 Ghabrivirales 4 科
          • 金色病毒科 Chrysoviridae 2 属
          • 巨大双分RNA病毒科 Megabirnaviridae 1 属
          • 四组分病毒科 Quadriviridae 1 属
          • 整体病毒科 Totiviridae 5 属
      • 呼肠孤病毒纲 Resentoviricetes 1 目
        • 呼肠孤病毒目 Reovirales 1 科
          • 呼肠孤病毒科 Reoviridae 2 亚科
      • 维达弗病毒纲 Vidaverviricetes 1 目
        • 明迪奇病毒目 Mindivirales 1 科
          • 囊状噬菌体科 Cystoviridae 1 属
    • 黄色病毒门 Kitrinoviricota 4 纲
      • 阿尔法病毒超群纲 Alsuviricetes 3 目
        • 戊肝病毒目 Hepelivirales 4 科
          • 阿尔法四体病毒科 Alphatetraviridae 2 属
          • 甜菜坏死黄脉病毒科 Benyviridae 1 属
          • 戊型肝炎病毒科 Hepeviridae 2 属
          • 风疹病毒科 Matonaviridae 1 属
        • 马特利病毒目 Martellivirales 7 科
          • 雀麦花叶病毒科 Bromoviridae 6 属
          • 长线形病毒科 Closteroviridae 4 属, 7 种
          • 内源病毒科 Endornaviridae 2 属
          • 北岛病毒科 Kitaviridae 3 属
          • 梅奥病毒科 Mayoviridae 2 属
          • 披膜病毒科 Togaviridae 1 属
          • 植物杆状病毒科 Virgaviridae 7 属
        • 芜菁黄花叶病毒目 Tymovirales 5 科
          • 阿尔法线形病毒科 Alphaflexiviridae 7 属
          • 贝塔线形病毒科 Betaflexiviridae 2 亚科
          • 德尔塔线形病毒科 Deltaflexiviridae 1 属
          • 伽马线形病毒科 Gammaflexiviridae 1 属
          • 芜菁黄花叶病毒科 Tymoviridae 3 属, 2 种
      • 黄病毒超群纲 Flasuviricetes 1 目
        • 黄热病毒目 Amarillovirales 1 科
      • MAG病毒纲 Magsaviricetes 1 目
        • 野田村病毒目 Nodamuvirales 2 科
          • 野田村病毒科 Nodaviridae 2 属
          • 西奈-卤病毒科 Sinhaliviridae 1 属
      • 塔卢卡病毒纲 Tolucaviricetes 1 目
        • 番茄丛矮病毒目 Tolivirales 3 科
          • 香石竹斑驳病毒样四体病毒科 Carmotetraviridae 1 属
          • 黄症病毒科 Luteoviridae 3 属, 7 种
          • 番茄丛矮病毒科 Tombusviridae 3 亚科
    • 光滑裸露病毒门 Lenarviricota 4 纲
      • 突变病毒纲 Allassoviricetes 1 目
      • 二十病毒纲 Amabiliviricetes 1 目
      • 豪厄尔镇病毒纲 Howeltoviricetes 1 目
        • 板栗疫病真菌病毒菌目 Cryppavirales 1 科
          • 线粒体病毒科 Mitoviridae 1 属
      • 密病毒纲 Miaviricetes 1 目
        • 欧尔里病毒目 Ourlivirales 1 科
          • 博图欧尔密病毒科 Botourmiaviridae 4 属
    • 負核糖病毒門 Negarnaviricota 2 亚门
      • 简单病毒亚门 Haploviricotina 4 纲
        • 春秋病毒纲 Chunqiuviricetes 1 目
          • 穆病毒目 Muvirales 1 科
            • 秦病毒科 Qinviridae 1 属
        • 米尔恩病毒纲 Milneviricetes 1 目
          • 蛇状病毒目 Serpentovirales 1 科
            • 蛇形病毒科 Aspiviridae 1 属
        • 单荆病毒纲 Monjiviricetes 2 目s
          • 荆楚病毒目 Jingchuvirales 1 科
            • 楚病毒科 Chuviridae 1 属
          • 单股反链病毒目 Mononegavirales 11 科
            • 节肢动物病毒科 Artoviridae 2 属
            • 玻那病毒科 Bornaviridae 3 属
            • 丝状病毒科 Filoviridae 6 属
            • 李氏蜘蛛病毒科 Lispiviridae 1 属
            • 真菌单分子负链RNA病毒科 Mymonaviridae 2 属
            • 尼亚米病毒科 Nyamiviridae 6 属
            • 副黏液病毒科 Paramyxoviridae 4 亚科, 3 属
            • 肺病毒科 Pneumoviridae 2 属
            • 弹状病毒科 Rhabdoviridae 30 属
            • 阳光病毒科 Sunviridae 1 属
            • 新城蚊子病毒科 Xinmoviridae 1 属
        • 允常病毒纲 Yunchangviricetes 1 目
          • 勾践病毒目 Goujianvirales 1 科
            • 越病毒科 Yueviridae 1 属
      • 复杂病毒亚门 Polyploviricotina 2 纲
        • 艾略特病毒纲 Ellioviricetes 1 目
          • 布尼亚病毒目 Bunyavirales 12 科
            • 沙状病毒科 Arenaviridae 4 属
            • 甲壳类林肯病毒科 Cruliviridae 1 属
            • 费莫病毒科 Fimoviridae 1 属 (无花果花叶病毒科)
            • 汉坦病毒科 Hantaviridae 4 亚科
            • 利什曼原虫布尼亚病毒科 Leishbuviridae 1 属
            • 多足类湖北病毒科 Mypoviridae 1 属
            • 内罗病毒科 Nairoviridae 3 属
            • 泛布尼亚病毒科 Peribunyaviridae 4 属
            • 幻影病毒科 Phasmaviridae 5 属
            • 白纤病毒科 Phenuiviridae 19 属
            • 番茄斑萎病毒科 Tospoviridae 1 属
            • 武汉蜈蚣病毒科 Wupedeviridae 1 属
        • 流感病毒纲 Insthoviricetes 1 目
          • 分割病毒目 Articulavirales 2 科
            • 罗非鱼病毒科 Amnoonviridae 1 属
            • 正粘病毒科 Orthomyxoviridae 7 属
    • 小RNA病毒超群门 Pisuviricota 3 纲
      • 双链-小双节RNA病毒纲 Duplopiviricetes 1 目
        • 双链RNA病毒目 Durnavirales 4 科
          • 混合病毒科 Amalgaviridae 2 属
          • 低毒性病毒科 Hypoviridae 1 属
          • 分体病毒科 Partitiviridae 5 属, 15 种
          • 小双节病毒科 Picobirnaviridae 1 属
      • 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes 3 目
        • 網巢病毒目 Nidovirales 8 亚目 (嵌套病毒目)
          • 深海病毒亚目 Abnidovirineae 1 科
            • 深海病毒科 Abyssoviridae 1 亚科
          • 亚目 Arnidovirineae 4 科
            • 動脈炎病毒科 Arteriviridae 6 亚科
            • Cremegaviridae 1 亚科
            • Gresnaviridae 1 亚科
            • Olifoviridae 1 亚科
          • 冠狀病毒亚目 Cornidovirineae 1 科
            • 冠狀病毒科 Coronaviridae 2 亚科
          • 海洋病毒亚目 Mesnidovirineae 2 科
            • Medioniviridae 2 亚科
            • 中等嵌套病毒科 Mesoniviridae 1 亚科
          • 亚目 Monidovirineae 1 科
            • Mononiviridae 1 亚科
          • 亚目 Nanidovirineae 2 科
            • Nanghoshaviridae 1 亚科
            • Nanhypoviridae 1 亚科
          • 桿狀網巢病毒亚目 Ronidovirineae 2 科
            • 真桿狀網巢病毒科 Euroniviridae 2 亚科
            • 桿狀網巢病毒科 Roniviridae 1 亚科
          • 亚目 Tornidovirineae 1 科
            • Tobaniviridae 4 亚科
        • 微小核糖核酸病毒目 Picornavirales 8 科
          • 杯状病毒科 Caliciviridae 11 属
          • 双顺反子病毒科 Dicistroviridae 3 属
          • 傳染性軟腐病病毒科 Iflaviridae 1 属
          • 海洋RNA病毒科 Marnaviridae 7 属
          • 小核糖核酸病毒科 Picornaviridae 63 属
          • 多顺反子类小RNA病毒科 Polycipiviridae 3 属
          • 伴生豇豆病毒科 Secoviridae 1 亚科, 5 属, 1 种
          • 红火蚁病毒科 Solinviviridae 2 属
        • 南方菜豆花叶病毒目 Sobelivirales 3 科
          • 囊孢虫RNA病毒科 Alvernaviridae 1 属
          • 杯状RNA病毒科 Barnaviridae 1 属
          • 南方菜豆花叶一品红病毒科 Solemoviridae 2 属
      • 星状-马铃薯病毒纲 Stelpaviricetes 2 目
        • 马铃薯病毒目 Patatavirales 1 科
        • 星状病毒目 Stellavirales 1 科
          • 星状病毒科 Astroviridae 2 属
    • 双RNA病毒科 Birnaviridae 7 属
    • 复制酶置换四体病毒科 Permutotetraviridae 1 属
    • 葡萄孢菌病毒属 Botybirnavirus 1 种
  • 副RNA病毒界 Pararnavirae 1 门
    • 酶录转逆病毒门 Artverviricota 1 纲
      • 逆转录病毒纲 Revtraviricetes 2 目
        • 布隆伯病毒目 Blubervirales 1 科
          • 嗜肝DNA病毒科 Hepadnaviridae 5 属
        • 反转录病毒目 Ortervirales 5 科
          • 贝勒-保罗病毒科 Belpaoviridae 1 属
          • 花椰菜花叶病毒科 Caulimoviridae 10 属
          • 转座病毒科 Metaviridae 2 属
          • 伪病毒科 Pseudoviridae 3 属, 1 种
          • 逆转录病毒科 Retroviridae 2 亚科
  • 多真菌病毒科 Polymycoviridae 1 属
  • 小节肢动物病毒科 Sarthroviridae 1 属
  • 烟草坏死卫星病毒属 Albetovirus 3 种
  • 绿萝卫星病毒属 Aumaivirus 1 种
  • 黍花叶卫星病毒属 Papanivirus 1 种
  • 烟草花叶卫星病毒属 Virtovirus 1 种

多变去氧核糖核酸病毒域 Varidnaviria

包含2界

  • 班福病毒界 Bamfordvirae 2 门
    • 核质病毒门 Nucleocytoviricota 2 纲
      • 巨病毒纲 Megaviricetes 3 目
      • 痘疹病毒纲 Pokkesviricetes 2 目
    • 质粒前体病毒门 Preplasmiviricota 2 纲
      • 独特病毒纲 Maveriviricetes 1 目
        • 依赖病毒目 Priklausovirales 1 科
          • 大病毒依赖科 Lavidaviridae 2 属
      • 保护病毒纲 Tectiliviricetes 4 目
        • 塔钟病毒目 Belfryvirales 1 科
          • 塔螺病毒科 Turriviridae 1 属
        • 卡拉马病毒目 Kalamavirales 1 科
          • 复层噬菌体科 Tectiviridae 3 属
        • 罗韦病毒目 Rowavirales 1 科
        • 比尼亚病毒目 Vinavirales 1 科
          • 覆盖噬菌体科 Corticoviridae 1 属
  • 海尔维蒂病毒界 Helvetiavirae 1 门 (瑞士病毒)
    • 分隔病毒门 Dividoviricota 1 纲
      • 莱塞病毒纲 Laserviricetes 1 目
        • 西班牙盐盒菌病毒目 Halopanivirales 1 科
          • 球脂状病毒科 Sphaerolipoviridae 3 属

地位未定种类

地位未定目:

  • 线状病毒目 Ligamenvirales 2 科

地位未定科:

  • 阿尔法卫星病毒科 Alphasatellitidae 2 亚科, 1 种
  • 瓶状病毒科 Ampullaviridae 1 属
  • 指环病毒科 Anelloviridae 14 属
  • 鳄梨日斑类病毒科 Avsunviroidae 3 属
  • 杆状病毒科 Baculoviridae 4 属
  • 双尾病毒科 Bicaudaviridae 1 属
  • 棒状病毒科 Clavaviridae 1 属
  • 芬兰湖病毒科 Finnlakeviridae 1 属
  • 微小纺锤形噬菌体科 Fuselloviridae 2 属
  • 球状病毒科 Globuloviridae 1 属
  • 滴狀病毒科 Guttaviridae 2 属
  • 嗜盐纺锤形噬菌体科 Halspiviridae 1 属
  • 肥大唾腺炎病毒科 Hytrosaviridae 2 属
  • 線極病毒科 Nimaviridae 1 属 (线头病毒科)
  • 裸杆状病毒科 Nudiviridae 2 属
  • 卵形病毒科 Ovaliviridae 1 属
  • 芽生噬菌体科 Plasmaviridae 1 属
  • 多去氧核糖核酸病毒科 Polydnaviridae 2 属
  • 带球病毒科 Portogloboviridae 1 属
  • 马铃薯纺锤形块茎类病毒科 Pospiviroidae 5 属
  • 嗜热圈形病毒科 Spiraviridae 1 属
  • 奇古菌纺锤形噬菌体科 Thaspiviridae 1 属
  • 番茄曲叶卫星病毒科 Tolecusatellitidae 2 属
  • 三层病毒科 Tristromaviridae 1 属

地位未定属:

  • 丁型肝炎病毒属 Deltavirus 1 种
  • 沟鞭藻DNA病毒属 Dinodnavirus 1 种
  • 壶菌病毒属 Rhizidiovirus 1 种

亞病毒因子(Subviral Agents)

衛星(Satellites)

  • 卫星病毒 Satellite virus
    • 单链核糖核酸卫星病毒 Single-stranded RNA satellite virus
    • 双链DNA卫星病毒 Double-stranded DNA satellite virus
    • 属未定
  • Satellite nucleic acid
    • Single-stranded satellite DNA
    • Double-stranded satellite RNA
    • Single-stranded satellite RNA
    • RNA satellite
    • 属未定

類病毒(Viroids)

  • Pospiviroidae
    • Pospiviroid
    • Hostuviroid
    • Cocadviroid
    • Apscaviroid
    • Coleviroid
    • 属未定
  • Avsunviroidae
    • Avsunviroid
    • Pelamoviroid
    • Elaviroid
  • 科未定

朊毒體(Prions)

  • Mammal-prion
  • Fungi-prion

干扰缺损病毒(Defective Interfering)

  • 缺损干扰RNA Defective Interfering RNA
  • Defective interfering particle


  1. Fields p. 27
    • As defined therein, "a virus species is a polythetic class of viruses that constitute a replicating lineage and occupy a particular ecological niche". A“polythetic" class is one whose members have several properties in common, although they do not necessarily all share a single common defining one. Members of a virus species are defined collectively by a consensus group of properties. Virus species thus differ from the higher viral taxa, which are“universal”classes and as such are defined by properties that are necessary for membership.
  2. (英文)Delwart EL. . Rev. Med. Virol. 2007, 17 (2): 115–31. PMID 17295196. doi:10.1002/rmv.532.
  3. . talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. [26 April 2020].
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