Y RNA
Y RNA係一種短非編碼RNA。它是Ro60核糖核蛋白顆粒的組分之一[1]。在全身性紅斑狼瘡患者體內,它是患者自身抗體的攻擊目標之一[2]。Y RNA對DNA複製來說至關重要,因爲它們能與染色質和起始點識別複合物相互作用[3][4]。
Y RNA | |
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Y RNA的預想二級結構以及保守序列 | |
识别符 | |
代号 | Y_RNA |
Alt.代号 | Y1; Y2; Y3; Y5 |
Rfam | RF00019 |
其他数据 | |
RNA类型 | 基因 |
域 | 真核生物 |
功能
目前,已知Y RNA有兩大功能:一,抑制Ro60;二,作爲DNA複製的一種起始因子。失去了保守的與Ro60蛋白的結合位點的突變人類Y RNA仍然能參與DNA複製[3],這說明與Ro蛋白結合以及啓動DNA複製是Y RNA的兩種互不相干的功能。儘管Y RNA的衍生小型RNA大小與微RNA相當,但是它們卻和微RNA在功能上卻毫無關係[8]。
分佈
已在真核細胞與細菌中發現了被推定爲Y RNA和Ro蛋白質的物質[6][13]。人類應有4種Y RNA,分別是hY1、hY3、hY4,以及hY5[13]。另外,人體內也有很多與Y RNA相關的假基因。秀麗隱桿線蟲(C. elegans)則有1種Y RNA,名爲CeY RNA。該生物體內許多sbRNA也被認爲可能與Y RNA同源[14][15]。抗輻射奇異球菌(Deinococcus radiodurans)編碼一種與Ro蛋白同源的蛋白質,名爲rsr(Ro sixty related,意爲第六個與Ro有關的)。用UV燈對該菌進行照射,可以誘導編碼rsr的基因的表達。在該情況下,抗輻射奇異球菌的菌體內至少會出現4種短RNA,其中一種RNA似乎與Y RNA具有同源性[16]。
參考
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- Lerner, MR; Boyle JA; Hardin JA; Steitz JA. . Science. 1981, 211 (4480): 400–402. PMID 6164096. doi:10.1126/science.6164096.
- Christov CP, Gardiner TJ, Szüts D, Krude T. . Mol. Cell. Biol. 2006, 26 (18): 6993–7004. PMC 1592862. PMID 16943439. doi:10.1128/MCB.01060-06.
- Zhang, AT; Langley, AR; Christov, CP; Kheir, E; Shafee, T; Gardiner, TJ; Krude, T. . Journal of Cell Science. Jun 15, 2011, 124 (Pt 12): 2058–69. PMC 3104036. PMID 21610089. doi:10.1242/jcs.086561.
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- Green, CD; Long KS; Shi H; Wolin SL. . RNA. 1998, 4 (7): 750–765. PMC 1369656. PMID 9671049. doi:10.1017/S1355838298971667.
- Biogenesis of Y RNA-derived small RNAs is independent of the microRNA pathway. Francisco Esteban Nicolas, Adam E. Hall, Tibor Csorba, Carly Turnbull, Tamas Dalmay. FEBS Letters. 2012 April; 586(8):1226-1230. doi:10.1016/j.febslet.2012.03.026.
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- Chen X, Wurtmann EJ, Van Batavia J, Zybailov B, Washburn MP, Wolin SL. . Genes Dev. 2007, 21 (11): 1328–39. PMC 1877746. PMID 17510283. doi:10.1101/gad.1548207.
- Christov CP, Trivier E, Krude T. . Br. J. Cancer. March 2008, 98 (5): 981–8. PMC 2266855. PMID 18283318. doi:10.1038/sj.bjc.6604254.
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外部連結
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