亲水指数
某种氨基酸的亲水指数（hydropathy index）是一个描述其支链的亲水性或疏水性程度大小的值。“亲水指数”于1982年被Jack Kyte与Russell Doolittle提出。[1]亲水指数越大，这种氨基酸的疏水性就越强。
亲水指数是根据蒸汽至水相转移的ΔtrGmɵ以及在形成蛋白质时氨基酸在表面和内部的分布测算的。疏水性最强的两种氨基酸分别是异亮氨酸（亲水指数为4.5）与缬氨酸（亲水指数为4.2）；亲水性最强的两种氨基酸分别是精氨酸（亲水指数为-4.5）和赖氨酸（亲水指数为-3.9）。
| R | K | N | D | Q | E | H | P | Y | W | S | T | G | A | M | C | F | L | V | I |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| -4.5 | -3.9 | -3.5 | -3.5 | -3.5 | -3.5 | -3.2 | -1.6 | -1.3 | -0.9 | -0.8 | -0.7 | -0.4 | 1.8 | 1.9 | 2.5 | 2.8 | 3.8 | 4.2 | 4.5 |
| R | K | D | Q | N | E | H | S | T | P | Y | C | G | A | M | W | L | V | F | I |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| -2.5 | -1.5 | -0.90 | -0.85 | -0.78 | -0.74 | -0.40 | -0.18 | -0.05 | 0.12 | 0.26 | 0.29 | 0.48 | 0.62 | 0.64 | 0.81 | 1.1 | 1.1 | 1.2 | 1.4 |
用途
亲水指数在蛋白质结构的研究中十分重要。具有疏水性的氨基酸在蛋白质的三维结构中更常见于蛋白质的内部，而具有亲水性的氨基酸更常出现在蛋白质的表面。
另一个重要用途是预测膜蛋白在细胞膜中的分布。如果发现膜蛋白有连续二十个左右的氨基酸都具有较强的疏水性，那么很有可能这一段氨基酸是膜蛋白横跨细胞膜的部分。
参见
- Kyte J, Doolittle RF. . J. Mol. Biol. 1982年5月, 157 (1): 105–32 [2010-02-27]. PMID 7108955. doi:10.1016/0022-2836(82)90515-0. （原始内容存档于2018-01-25）.
- Eisenberg D. . Ann. Rev. Biochem. 1984年7月, 53: 595–623. PMID 6383201. doi:10.1146/annurev.bi.53.070184.003115.
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