真·女神轉生III－Nocturne

時間是21世紀的某年某日，在東京都就讀高中的主角應邀與同班同學探望留院的班主任。在乘坐地鐵的路程中在小睡中看到班主任發出的啟示，得知世界在片刻後將要迎接為準備重生而帶來的毀滅。主角離開地鐵站時聽到周遭人滿不在乎的公園工地流血暴力事件，碰上想採訪事件的神祕學記者。抵達了充滿謠言的醫院後終於與兩個約好的同學會合，遊蕩中遇上暴力事件的中心人物冰川，在準備召喚惡魔下毒手之際獲班主任相救，被帶到屋頂目擊班主任所指的毀滅──「受胎」，世界被破壞、除了留在下了結界的醫院外全部生命都被消滅。東京被裹覆在一球體內，其正中央是為這受胎輸出能量的「迦具土」，如此構成了「旋渦界」，等候創世的「攝理」為世界帶來新生。

主角

無預設名字，本遊戲的沈默的主角。原本是東京都內一名普通高中生，被其班主任誘到下了結界的醫院使他在受胎中生還。受胎後被神祕的金髮小孩及他的老褓姆強行植入「禍魂」，獲得了惡魔的肉體戰鬥。在故事發展到中期被稱作為人修羅左右著創世的結果。

高尾佑子

主角、千晶和勇的班主任，在任教的學校中受到學生愛戴的教師。故事開始前以患病為由入院，實質協助冰川啟動受胎。出於對主角的特殊好感而利用千晶和勇誘使他進入下了合界的醫院，在受胎開始前的一刻告訴主角自己將會成為新世界中央的巫女引導主角在旋渦界的道路。

故事中段她表示協助觸發受胎是因為她不喜歡舊有的世界，認為那裡的人們只會自顧自，亦不懂得追求更好的人生。另一方面她又不認同冰川的創世理念，但高尾主張的自由意志因為與創世原則違背而苦於缺少創世必需的攝理。

冰川

表面上是某大電信公司的總技術幹事，實質是女神轉生系列秩序與混沌鬥爭中代表後方的教派──「蓋亞教」的骨幹成員。在蓋亞教的書庫中找到記載創世祕密的《彌勒經》（內容屬故事虛構）而決定啟動受胎。他的創世攝理是「默」（寂靜），在這個世界生活的每個人都拋棄自己的情感，只懂得作為轉動世界的齒輪而活。高尾佑子認為這樣的世界是一個失去活力，只有時間流動的死城。

新田勇

主人公的同班同学。性格明朗，非常尊敬裕子老师。和主人公一起前往新宿看望住院的裕子。东京受胎以后生存下来的少数人类之一。

橘千晶

主人公儿时的玩伴，同校学生。出身富裕家庭，性格冷静，早熟。和主人公一起前往新宿看望住院的裕子。东京受胎以后生存下来的少数人类之一。

聖丈二

某神秘学刊物的记者。事先就知道异变的人之一。也是东京受胎以后生存下来的少数人类之一。经常给予主人公各种帮助。

• 「2身合体」：恶魔合体的基本。将两个相对弱小的恶魔合体，创造出更强力的恶魔。1+1＞=2。
• 「イケニエ合体」：“祭品合体”之意。在通常的2身合体上，再增加一名恶魔作为牺牲，提高合体以后恶魔的等级和能力