魔法少女小圓漫畫作品

本作劇本化之前的台詞被忠實重現，但因媒體特性，漫畫未能反映原作中的若干設定。此外，基於同一劇本所創作的漫畫、電視動畫2種版本各有其取捨追加，發揮了相互補充的作用[4][5]。關於雙方的具體差異，漫畫的後記、雜誌的報導以及作者的Twitter皆有提及，以下為列舉：

• 原作的丘比沒有表情變化，漫畫版則擁有豐富的表情[5]。眼神的描繪也不一樣[4]，不過根據設定，這些表情變化只是偽裝，都是為了親近人類刻意表現出來的，一旦露出本性就會跟動畫版一樣沒有變化，而且眼睛配色也會變得比較恐怖。
• 魔法少女們的武器形狀、攻擊手段皆有異同[5]。在漫畫中，曉美焰的盾變成菱形，美樹沙耶香手持沒有拳套的雙刃直劍，佐倉杏子的長槍呈十字架形狀，結局中鹿目圓的弓呈翅膀狀[4]。
• 戰鬥的描寫皆由漫畫獨創，因劇本並未著墨於此。
• 原作當中的建築設計與室內裝潢，漫畫均未凸顯。
• 原作曉美焰在因鹿目圓的願望而重組的世界中的髮型跟重組前一樣，只是髮飾換成鹿目圓給的髮帶，漫畫中則是把髮型換成雙馬尾。
• 結局內容不同。原作被片尾曲分開的B-PART與C-PART橋段在漫畫中合而為一，並增加了圓與焰約定永恆友情的劇情。

第1冊封面左上角印有馬丁·路德·金的名言：「黑暗不能驅除黑暗，只有光明可以做到；仇恨不能驅除仇恨，只有愛可以做到。（Darkness cannot drive out darkness; only light can do that. Hate cannot drive out hate; only love can do that.）」

第2冊、第3冊封面左上角均印有本作其中一段劇情概要：「她還不知道這份邂逅是偶然還是必然，但這相遇將會改變她的命運...（She will not know yet if this encounter is a mere coincidence or a necessity. Which would be, an encounter that would change her destiny——）」

冊數	芳文社		東立出版社
	發售日期[6]	ISBN	發售日期	ISBN
1	2011年2月12日	ISBN 978-4-8322-7990-2	2011年8月5日[註 1]	EAN 471-0945-54114-3（限定版） ISBN 978-986-10-8318-6
2	2011年3月12日	ISBN 978-4-8322-4003-2	2011年10月5日	ISBN 978-986-10-8319-3
3	2011年5月30日	ISBN 978-4-8322-4014-8	2011年12月5日[註 2]	ISBN 978-986-10-8320-9

巴麻美是獨自一人在見瀧原町討伐魔女的魔法少女，某一天，相鄰的風見野町的魔法少女佐倉杏子來到此地。某次遭遇戰之後，杏子請求麻美收自己為徒，2人開始搭擋共同行動。然而，杏子的牧師父親偶然得知魔法少女的真相，成為佐倉家崩潰的發端。杏子特有的幻惑魔法也變得無法使用。家破人亡促使杏子改變想法，進而與麻美對立，分道揚鑣。

一段時日後，麻美在鹿目圓的通知下進入結界討伐零食魔女，陷入危機之際因美樹沙耶香參戰得而解圍，於是3人開始共同行動。此時回到見瀧原町的杏子，為討伐魔女之夜，與曉美焰暗中結盟......

• 巴麻美締結的是「維繫生命」的契約，體現為發射緞帶的魔法。
• 佐倉杏子特有的「幻惑魔法」
  • 可製造分身影像迷惑對手。但在原作的時間點已遺忘用法。
  • 被麻美命名為「Rosso Fantasma（紅幽靈）」。
• 杏子結識麻美早於鹿目圓、美樹沙耶香。
• 麻美曾受邀作客佐倉家，這也是杏子首次邀訪朋友。
• 佐倉家崩潰的細節與真相。

• 在原作結局中，美樹沙耶香因打敗魔獸力竭而亡，其對手為涅槃魔獸（最強的魔獸），而非在原作現身的普通魔獸。[註 3]
• 在原作結局中，曉美焰獲得的新魔法為「記憶操縱」，[註 4]日後在「非魔法少女」的型態時依舊可用（見［新篇］）。
• 魔獸共有4種型態，皆以人類（包括魔法少女）的正負面感情為食糧，會吸收魔法少女的魔力，其餘共通點繼承原作（持有小型立方體形狀的悲嘆之種、沒有眷屬、群體行動）。能力由低至高分別為：[9]
  • 魔獸（普通）：原作結局已登場，外表像一群剃髮的男性僧侶，看不出個體差異。攻擊手段為鐳射光。
  • 修道魔獸：本作初登場，外表呈盤腿坐姿，手持燃燒的短槍，全身滾燙呈漂浮狀。攻擊手段為掌心射出銅劍，揮舞短槍。
  • 悟道魔獸：本作初登場，外表是破碎的男性上半身，無頭無手，環繞破碎的方塊狀內臟與幾何狀器官，周身漂浮。攻擊手段是投擲內臟、並使物質發生乾燥、風化、腐蝕與解體現象。
  • 涅槃魔獸：本作初登場，被巴麻美稱為「大型魔獸」，外表是完全的幾何造型，環繞更多的方塊，周身漂浮。攻擊手段不明，一擊就能打破佐倉杏子的「穿針引線」結界。

與丘比簽約成為魔法少女的美國織莉子，擁有預知未來的能力，並由此得知自己與見瀧原町的毀滅性結局。決心改變這一切的織莉子開始關注一名丘比感興趣的「擁有極佳魔法少女素質」的少女。

另一方面，為討伐魔女而來到見瀧原町的佐倉杏子，與雙親慘遭魔女殺害的少女——千歲由真相遇。成為孤兒的由真開始親近杏子，杏子也將她當作妹妹看待。於此同時，已導致多名魔法少女遇害的「獵殺魔法少女」正橫行此地，為了守護杏子、由真與見瀧原町，巴麻美與晓美焰被捲入了「獵殺鹿目圓」的巨大陰謀......。

每集封面左上角均印有：「這將是，一個會改變她命運的事件—— 這將是，完全另一個魔法少女故事的開始——（WHICH WOULD BE, AN INCIDENT THAT WOULD CHANGE HER DESTINY— WHICH WOULD BE, THE BEGINNING OF A WHOLE ANOTHER MAGICAL-GIRL TALE—）」

冊數	芳文社		東立出版社
	發售日期	ISBN	發售日期	ISBN
1	2011年5月12日	ISBN 978-4-8322-4016-2	2011年12月28日	ISBN 978-986-10-8702-3
2	2011年6月13日	ISBN 978-4-8322-4036-2		ISBN 978-986-10-8703-0

本作的番外篇作品分別為《魔法少女小織〜noisy citrine〜》（日语：）為搞笑番外篇漫画作品，於《MANGA TIME KIRARA☆MAGICA》第2号、第3号連載，全2話。《魔法少女小織〜symmetry diamond～》（日语：），於《MANGA TIME KIRARA☆MAGICA》第5号至第7号連載，全3話。《[新約] 魔法少女小織〜sadness prayer～》（日语：），於《MANGA TIME KIRARA☆MAGICA》第10号至第30号連載，全24話。

單行本收錄兩個衍生作《魔法少女小織〜noisy citrine〜》、《魔法少女小織〜symmetry diamond～》。

魔法少女小織〜noisy citrine〜

描述織莉子的同伴吳希里華簽約之初的故事。

魔法少女小織〜symmetry diamond〜

描述為戰勝即將到來的魔女之夜，織莉子與吳希里華共同行動著，但織莉子仍無法控制預知能力的魔力消耗。某日夜晚，織莉子隻身外出時在公園遇到一名少女，彼此飲茶談天。但織莉子隨即以預知見到，她們話別之後，這名少女——千歲由真慘遭母親殺害的新聞報導。此時，與丘比重逢的魔法少女優木沙沙（日语：）為爭奪地盤，將殺意對準了織莉子一行人......

少女注意到了，自己置身於黑暗裡。似乎發出了說話的聲響，但她看不到講話的男人。自己為何裸體、被關在手提箱裡已不復記憶，少女只記得「和美」這個名子而已。

風波過後，和美與找回自己的2名少女——御崎海香、牧薰恢復同居的生活。在隨後發生的惡性事件中，和美想起自己曾是魔法少女的事情。被告知失憶前曾與另外4人共組「昴宿星圣团」的實情後，和美決定恢復一行7人討伐魔女的生活。

然而某天，出現1名憎恨「昴宿星圣团」的魔法少女，她們自此被捲入殘酷的命運......

魔女MADOKI（）

正式名稱不明。人體埋入恶意之种的一般人出現負面感情後變化而成。與魔女的性質不同，變形的人被打敗後不會死亡。

惡意之實（）

类似悲叹之种的伪品，在翌桧市流通。惡意之種外觀雖然與悲嘆之種很相似，但不具備悲嘆之種的功能，不能被柔比和丘比回收。在剧情後期表明是「if」为了消耗昂星团的魔力而制造出来的。

• 魔法少女小圓 小焰復仇記!（日语：）
• 焰過來（日语：）
• 歡迎光臨悲嘆之種☆咖啡館（日语：）
• 魔法少女小圓社（日语：）
• POMU☆魔力（日语：）
• 見瀧原幼稚園魔法班（日语：）
• 巴麻美的平凡日常（日语：）
• 魔法少女小織 〜noisy citrine〜（日语：）
• 漂流小圓（日语：）
• 魔法少女小織 〜symmetry diamond〜（日语：）

• 焰的假日（日语：）
• 魔法少女病（日语：）
• 集合！小圓學園（日语：）
• GAME OVER〜再也不依靠任何人〜（日语：）
• 魔法少女雲母（日语：）
• 最佳合作夥伴！（日语：）
• 更多！（日语：）
• 晚餐是幸福的味道（日语：）
• 丘比的受難...（日语：）
• 巴麻美的食慾（日语：）
• 奇蹟與魔法與後悔（日语：）（荒井チェリー、Vol.4）
• 雪兔與愉快的朋友們（日语：）
• 沒用的焰。〜直到她弄丟眼鏡〜（日语：）（ざら、Vol.5）
• ○○丘比（日语：）（仏さんじょ、Vol.5）
• 小圓的下一步（日语：）
• 表演女孩子（日语：）
• 笑容與鬼與汽水。（日语：）
• 為我而絕望！（日语：）
• 夜間潛水（日语：）（袴田めら、Vol.7）
• 焰的某次叛亂（日语：）（里好、Vol.8）
• 你和我和她（日语：）（霜月絹鯊、Vol.8）
• 杏子與狗（日语：）
• 魔法少女小焰☆田村〜平行世界不一定總是平行的。〜（日语：）

• 魔法少女小圓 小焰復仇記!（日语：）
  1. 2013年9月12日发售 ISBN 978-4-8322-4349-1
  2. 2013年12月12日发售 ISBN 978-4-8322-4381-1
• 1. 2013年9月27日发售 ISBN 978-4-8322-4354-5
  2. 2015年2月27日发售予定 ISBN 978-4-8322-4533-4
• 1. 2013年9月27日发售 ISBN 978-4-8322-4355-2
  2. 2015年2月27日发售予定 ISBN 978-4-8322-4534-1
• 1. 2013年10月12日发售 ISBN 978-4-8322-4359-0
• 巴麻美的平凡日常（日语：）
  1. 2013年10月12日发售 ISBN 978-4-8322-4358-3
  2. 2014年8月11日发售 ISBN 978-4-8322-4468-9
• 歡迎光臨悲嘆之種☆咖啡館（日语：）
  • 全1冊、2013年10月26日发售 ISBN 978-4-8322-4365-1
• 魔法少女小焰☆田村〜平行世界不一定總是平行的。〜（日语：）
  1. 2013年10月26日发售 ISBN 978-4-8322-4364-4
• 1. 2013年11月27日发售 ISBN 978-4-8322-4376-7
• 1. 2013年11月27日发售 ISBN 978-4-8322-4375-0
• 1. 2013年12月12日发售 ISBN 978-4-8322-4382-8
• 1. 2013年12月26日发售 ISBN 978-4-8322-4390-3
• 1. 2015年2月27日发售 ISBN 978-4-8322-4535-8