臺北市立聯合醫院

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本名臺北市立中興醫院，地址為臺北市大同區鄭州路145號（市民大道一段），目前市立聯院總院行政大樓亦設於此，與衛生福利部臺北醫院城區分院相對。

2007年，和平院區與婦幼院區合併為和平婦幼院區，原院區則為「和平分部」與「婦幼分部」。和平分部，本名臺北市立和平醫院，座落於中華路廣州街口，地址為臺北市中正區中華路二段33號 ，因SARS事件聞名全國。目前與婦幼院區合為單一院區，統稱和平婦幼院區，加上鄰近老年民眾眾多，是一所從幼童、青壯年到老年人都能共同照顧的綜合社區醫院。藉由照顧弱勢族群，結合社區基層醫療體系，促進社區健康服務，以達到善盡公立醫院社會責任。

2007年，和平院區與婦幼院區合併為和平婦幼院區，原院區則為「和平分部」與「婦幼分部」。婦幼分部，本名臺北市立婦幼綜合醫院，座落於福州街南昌路口，地址為台北市中正區福州街12號，共有兩棟大樓。目前該院主要以婦科與兒科為主，與郵政醫院隔南昌路相望。創院於1973年的婦幼院區，現有的醫療大樓自1981年啟用，考量現有設施已經老舊，院方於2005年11月封院整建，並於2006年11月重新開放。婦幼院區於2004年成立全國第一座母乳庫，開啟國內捐贈母乳的風氣。

本名臺北市立仁愛醫院，地址為臺北市大安區仁愛路四段10號，眼科、肝膽腸胃科、腫瘤科、神經外科為仁愛院區的重點科別，其中以肝癌治療為台灣的先驅。台灣第一例的肝腫瘤經皮酒精注射，還有肝腫瘤無線熱頻燒灼術，都是在此醫院進行。

本名臺北市立療養院，地址為臺北市信義區松德路309號，主要看診科目包括一般成人精神科、成癮防治科、心身醫學科、兒童青少年精神科、精神官能症、睡眠問題、老人神經精神醫學等，注重於心理、精神疾病醫療。目前為國內精神科專科醫師與住院醫師最多之專科訓練醫院，也和國家衛生研究院合作成立研究室，又稱為臺北市立聯合醫院精神醫學中心（Taipei City Psychiatric Center）。

本名臺北市慢性病防治院，地址為臺北市中山區林森北路530號，原為專科醫院，現已轉型為地區型醫院，看診科目設有內科、骨科、婦科、眼科、耳鼻喉科、皮膚科、家醫科、中醫科...等。

本名臺北市立中醫醫院/臺北市立性病防治所，地址為臺北市萬華區昆明街100號，該院區看診種類以中醫、性病、毒品病患為主。由於該院舍有兩個院區，一、二樓看中醫、樓看性病與毒品。有別於一般性病防治所，不註明該院區是服務性病患者的，也讓看診的民眾不會在進入院舍前引起路人指指點點。一樓是中醫門診中心，以中醫為主。

本名臺北市立陽明醫院，地址為臺北市士林區雨聲街105號。

本名臺北市立忠孝醫院，地址為臺北市南港區同德路87號 。

臺北市立聯合醫院、國立政治大學與國立陽明交通大學三方，於2006年12月23日簽定學術合作合約，建立通識教育及生物科技管理學程合作模式，仿效美國哈佛大學與周邊教學醫院之「聯盟醫療（Partners HealthCare system）」整合，結合人文科學、醫療服務及醫學研究的資源。[3][4]臺北市立聯合醫院仁愛院區在國立政治大學健康中心設有政大門診部，以規劃「打造首都健康大學城」為目標，服務對象為社區民眾、政大教職員及學生。[5][6]

臺北市立聯合醫院與國立臺灣大學醫學院在2015年3月19日簽訂合作協議，期待共創醫學、教育合作發展，推動實質交流合作。[7]