楊文科

• 2007年5月24日，農民張舜濱，在中科預定地，向台糖承租面積8公頃的土地，大量栽植9萬餘株神秘果，其中6萬餘株集中在約1公頃土地內，異常密集。[7]
• 張舜濱透過立法委員與中科官員居中協調，使中科籌備處同意辦理徵地補償，費用從初估的138萬5,175元，跳升到9,539萬8,650元。[8]
• 2007年6月，在台中縣政府與中科管理局的協商下，與張舜濱達成協議，將9,539萬8,650元匯入張舜濱戶頭。
• 因中科管理局堅持採用「特殊栽植」標準估價，引發外界質疑中科官員涉嫌多給補償從中圖利。於是台中檢調到中科管理局、中國生產力中心搜索，約談中科管理局長楊文科等7人，訊後飭回。[9]

楊文科擔任中科局長任內，因開發中科四期二林基地，執行「中科四期調度使用農業用水計畫工程」，擬調用濁水溪農業用水，引起彰化縣農民強烈抗議。2012年3月21日，楊文科局長向立委及農民表示「中科四期調度使用農業用水計畫工程」因農民有搶水危機疑慮，請廠商配合政府暫停進行「調度農業用水計畫」，惟因需針對已開挖的工區進行回填等道路鋪面復舊作業及必要安全措施，致外界有所誤會。但隨後工地馬上動工，重新進行打樁作業。農民在立委張曉風、林淑芬的陪同下於立法院召開記者會，抗議楊文科惡行，要求下台負責。最後國科會主委朱敬一面對無廠商、無長期水源之現實，提報行政院重新檢討中科四期開發計畫，並且暫停中科四期調用農業用水工程。[10]

• 2013年，中科后里園區，放流管工程投標案，中科管理局3官員涉嫌洩漏評委名單給特定廠商。投資組長王宏元未遵守利益迴避原則，與廠商負責人有資金往來；營建組長鐘文傳於放流管工程洩漏採購評選委員名單給特定廠商。[11]局長之楊文科遭監察院彈劾下台，[12]
• 針對洩漏名單一案，公務員懲戒委員會審議，楊文科對於該二員違失行為疏於監督及依法處置，有違公務員服務法，予以記過處份二次。[13]
• 同年辦理退休，以志工身分任新竹縣長邱鏡淳辦公室主任。[4]

楊文科擔任新竹瓦斯公司總經理任內，監察院2017年3月8日對新竹縣政府提出糾正案，監察委員尹祚芊提出：新竹縣政府未依法且怠於辦理新竹瓦斯股份有限公司輸儲設備之查核；該公司遲未訂定相關人事法規，滋生人員進用及陞遷之爭議、人事檔案未妥善保管致有佚失、瓦斯表之管理不當致生帳物不符、存貨及倉儲管理亦有缺失等，均核有違失，爰依法提案糾正乙案。[14]

• 2018年6月，立委林為洲準備參選新竹縣長超過半年，部分地方人士指控其不具備勝選的條件[15]，且因國民黨取消新竹縣長初選的全民調制度，直接徵召在各家民調和知名度都較低的楊文科，使林為洲不滿直呼：「我被做掉了！」[16]
• 2018年8月，林為洲宣佈脫黨參選新竹縣長[17]，並公布民調顯示其領先楊文科。[18]
• 2018年8月29日，林為洲在黨內大老的協調下於記者會上哽咽宣布退選。[19]楊文科表示感謝，會邀請他加入競選團隊。[20]

• 2018年10月23日，新竹縣縣長邱鏡淳調整地價稅，其中竹北市漲幅高達83.98%，引爆民眾前往縣政府抗議。當日下午副縣長楊文科也加入抗議，引發外界質疑楊文科角色錯亂，因地價稅調整是楊文科任內的政策，且經過會議表決通過，楊文科根本是「做賊喊捉賊」。[21]
• 2018年11月7日，楊文科召開記者會並出示第11次地價評議委員會紀錄，指該次會議主席是縣長邱鏡淳，是邱鏡淳拍板定案。誓言「將漲幅降回來」、「任內絕不調漲」，沒做到就辭職下台以示負責。[22]
• 2018年11月8日，外界質疑楊文科的說法，指出地價評議委員會的12次會議中，有10次是楊文科擔任主席，雖然第11次會議主席確實是邱鏡淳，但會議結論是裁示「由業務單位成立專案小組、授權業務單位簽奉核定」，尚未完成行政上的法定程序。最後的第12次會議，才是由楊文科擔任主席並拍板核准追認了業務單位的規劃，而且會議紀錄記載是「經出席委員全數同意」。[23]