杭州南站

杭州南站站房建筑面积90000平方米，共计5层[34]。站房由冯·格康，玛格及合伙人建筑师事务所（GMP）和铁道第三勘察设计院共同设计，建筑基座使用灰色花岗岩，白色的墙体以凸显杭州传统建筑文化；站房南北白色墙面设有多面通高的垂直百叶幕墙，以获得更好采光[35]；东西的墙面以铝板幕装饰墙拼而成，形成一幅“湘湖风景图”[36]。

车站设有东、西两个进站口，其中西进站口24小时开放，东进站口开放时间为为6点至22点。售票处位于站台层，分别位于站台层东、西面的进站口旁，共有24台自助取票机和13个人工售票窗口；站台层西侧还设有绍兴城际候车区[32]。出发层标高18米，东西侧的进站口暨实名验证通道，共有验证通道16个：其中自助验证通道12个，人工验证通道4个。车站候车室横跨股道上空，东西长220米、南北长55米、面积1.2万余平米；候车室内共设2640个座椅，最多同时可容纳13300名旅客候车，此外还设有10个自助售票机。高架候车室南北各设12个检票口，每个检票口设有4台自动检票机和1人工检票口[37]。候车室上方为商业夹层，据上海铁路局官网显示共有25家商户入驻，包括黄生记面铺、永和豆浆、康师傅私房牛肉面等[5]。

建设中的12站台

10、11站台（2018年10月）

萧山疏解区内分离出的杭深线杭甬客运专线及其联络线

杭州南站规划有4个车场，从西向东分别为越江场、普速场、杭甬场和杭长场，共7台21线。越江场为杭金衢城际铁路预留所用，目前暂时归为普速场，有沪昆铁路和萧甬铁路经过，共计3台10线，其中8、9站台原为低站台，后改为高站台[27]。杭甬场接杭深线和宁杭客运专线，规模2台6线；而杭长场则有沪昆客运专线接入，规模2台5线。新的站台序号从原先的由西向东改为由东向西[38]。

杭州南站南侧设有萧山疏解区，面积约61.4公顷，是目前中国国内最复杂的高速铁路疏解区[39]。沪昆客运专线和杭深线在疏解区南侧分别设有杭长杭州南线路所和杭甬杭州南线路所、通过4条疏解线形成互通[40]，而和杭黄客运专线则通过杭长杭州南线路所的渡线接入[38][41][42]。2016年1月10日启用杭州东至杭州南三四线、杭州东站南侧的宁杭甬场和沪杭长场南端的互通取消后，所以跨线列车需要在两个杭州南线路所提前进入对应站场（东站宁杭甬场对应南站杭甬场，东站沪杭长场对应南站杭长场）[43]。另外既有沪昆铁路正线、萧甬铁路正线和萧浙联络线亦在车站南侧形成三角疏解区[44]。疏解区地面建有新塘高铁公园[45]。

杭州南站设有东西两个站前广场。西广场位于站房西侧，占地3.8万平方米，一层设有公交首末站、出租车上客点、438个车位的停车场，二层则设有配套商业街等休闲设施，于2017年7月完工[36]。目前西广场商业配套已经基本确定，主要以餐饮为主，已确认有麦当劳、德克士、85度C、顺旺基、老娘舅、大娘水饺、吉祥馄饨、CoCo都可等餐饮品牌入驻[5]。

东广场位于站房东侧，是杭州南站的主广场，占地约10万平方米，设有商贸中心、高档写字楼、地铁火车南站、公交枢纽站、长途车服务站、旅游大巴车场、出租车停车场（100个）、社会车辆停车场（1100个）等综合服务设施[5][36]。

绍兴城际线的部分列车将贯通运营至本站。绍兴城际线并不在火车南站的候车大厅内乘坐，而是在西广场设有专门的候车区[48][46][32][49]。运营初期，杭州南到钱清区间可免费乘坐。[50][51]

杭州南站周边规划有“三纵四横”的疏散道路，三纵分别为南北向的通城大道、高新五路和商城北路；“四横”是指东西向的彩虹大道、郎家路、站前东路和商聚路；西广场设有上落客匝道连接对出的站前路和商城北（中）路[54]。其中位于车站北侧、东侧的彩虹大道和通城大道为快速路[55]。

杭州南站东、西广场均设有停车站，目前由于东广场未全部完工，仅开放西广场停车场[37]。

杭州地铁5号线火车南站位于杭州南站东广场地下，于2020年6月30日开通，也是规划中的杭州地铁11号线的换乘站。根据乘车安排，旅客国铁转地铁无需二次安检[52][37]。

杭州南站的东、西广场均设有公交场站。东广场为主要公交换乘站，有300、328、711、711B、720、726、747、731、736和743共11条始发公交，其中300路开往杭州站；西广场公交站有123、707、748、181停靠，其中123路开往杭州东站。另外东西广场间设有免费接驳公交[37]。后半夜则有8701路公交车连接萧山人民广场，7月30日起又开行至城站火车站的夜间通宵线8300路[56]。

2020年7月15日起萧山长运开通杭州南站西广场至杭州萧山国际机场专线[57]。

2020年7月2日20时30分左右，萧山城区出现强降雨，雨水从西广场倒灌入仅仅开放2天的杭州南站，导致车站出站层下通道积水。南站管委会等单位立即启动应急预案，疏导乘客，进行排水。当日23时30分左右，雨水已经基本排清[58]；保洁工作则于次日凌晨5时30分完成，次日晚23时30分现场基本恢复。萧山区当地有关部门于7月2日的解释认为此次积水系车站西广场附近的市政管网排水不畅导致，日后将对该区块进行排水改造；7月3日，萧山区杭州南站枢纽管委会发文称，此次雨水倒灌的原因系国铁站房及站台既有排水设施因当时瞬时雨量过大而无法排出导致积水，加上西广场部分露天扶梯及其他设施将积水引入出站层导致积水；声明同时承诺管委会将尽快提出整改方案，短期内将通过安排人员值守、配置临时强排泵等方式避免此次事件再次发生[59]。

杭州南站启用后承接了原先停靠杭州东站的大部分普速列车。但由于距离杭州市区较远且大部分接驳公共交通已停运，导致许多凌晨到站的旅客，尤其是低收入的打工者难以负担打车或住宿旅馆的费用，聚集在站前广场过夜至天亮，引发车站接驳安排的质疑。萧山公交公司于7月30日开通往萧山及杭州市区的8300路疏散了部分到站旅客[60][56]，但《钱江晚报》记者发现，8300开通后仍有去往余杭，萧山南片区的部分旅客滞留在南站[61]。