內政部警政署保安警察第二總隊

• 總隊長1人（警監）
  • 副總隊長1人（警正或警監）
  • 主任秘書1人（警正或警監）
  • 督察長1人（警正）

• 警務科
• 督訓科（科長由督察長兼任）
• 後勤科
• 秘書室
• 保防科
• 勤務指揮中心
• 人事室
• 主計室
• 資訊室（任務編組）

• 刑事警察大隊（新北市新店區）
  • 第一偵查隊（新北市中和區）
  • 第二偵查隊（臺中市南屯區）
  • 第三偵查隊（高雄市新興區）
• 第一大隊（高雄市楠梓區）
  • 第一中隊（第三核能發電廠）
  • 第二中隊（興達火力發電廠、南部科學工業園區臺南、高雄園區）
  • 第三中隊（經濟部加工出口區楠梓、高雄、屏東、臨廣加工區）
• 第二大隊（新北市新店區）
  • 第一中隊（第四核能發電廠）
  • 第二中隊（第一核能發電廠）
  • 第三中隊（第二核能發電廠）
• 第三大隊（臺中市南屯區）
  • 第一中隊（新竹科學工業園區竹南、龍潭園區）
  • 第二中隊（中部科學工業園區臺中、虎尾、后里園區、經濟部加工出口區中港、臺中加工區）
  • 第三中隊（經濟部、經濟部國營事業委員會、總隊部、安康訓練中心、大甲溪發電廠德基分廠）[8]

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