跨性別恐懼症

• 忽視跨性別、性別酷兒人士的存在：人們討論性別的現象的各個方面時（已包括女同性戀、男同性戀及雙性戀等不受生理性別認同影響的性傾向），忽略跨性別、性別酷兒人士，過度強調生物性別的社會命運，想當然地認為這些人不存在或是不重要，或是不值得被包括進來。然而，不將他們包括在內的話，關於人類性別的現象的討論實質上只是針對順性別的討論而已。
• 將跨性別、性別酷兒人士與順性別者區別看待：當議題與性別認同無關時，將某些性別認同群體與其他人區別看待是一種歧視。
• 將跨性別、性別酷兒等性別少數群體一起混入一個較大的範疇：有時，在分析數據時根據性別認同分類是合理的，例如對於青少年自殺率的研究。如果不包含性別認同這個分類範疇，研究結果可能會失真。[6]

許多跨性別者的雙親、手足以及其他家人無法接受自己孩子的跨性別身分，常常會有想要矯正性其性別認同的行為，包含強制更改髮型與衣著、限制其經濟與交友，以及辱罵、體罰、禁足等家庭暴力問題，甚至將之趕出家門，這對於尚在求學階段的跨性別兒童與青少年是很大的身心傷害，並且影響了跨性別兒少的受教權與人身安全。

許多工作機會會將跨性別者排除，使跨性別者陷入貧窮，而且即使有工作，職場上也常常有性別歧視與性騷擾問題，對於跨性別者是更加地惡化，同事之間的排擠與空間使用也都是問題。

現有教育體系對跨性別者不友善，男女有很清楚的劃分，甚至影響跨性別者的升學機會(男校、女校)，校園霸凌也相當嚴重，卻不易獲得師長的支持，甚至師長也成為霸凌者。

許多房東會歧視跨性別者而拒絕承租，或是因為其他房客抱怨而趕走跨性別房客，而很多承租規定本就有二元的性別劃分而排除跨性別者。

廁所、更衣室等等會特別標的性別，而跨性別者在使用這些空間有時會遭到排除、恐懼與暴力對待。像是少數順性別女性對於跨性別女性使用女性空間感到不安，有罪推定的認為對方會對自己不利(性侵、偷窺、裝監視攝影機等)，因此可能口出惡言甚至檢舉通報。

有些女性主義者，常常過分強調男女天生的生理性別差異，並且認為跨性別女性不是真正的女人(Real Women)，不屬於女權運動的一份子。尤其是多數激進女性主義者，認為性別氣質與性別認同是父權建構的，並且認為跨性別女性是男人，而對跨性別者(尤其是跨性別女性)有所排斥。因此被跨性別社群稱為TERF(Trans-Exclusionary Radical Feminists)。但其實跨性別女性與其他女性一樣面臨著因女性身分所遭遇的歧視、貶抑、騷擾、暴力甚至謀殺等等，且常常比順性別女性處境更加艱辛。

男同性戀與女同性戀社群常常在LGBT運動中忽視甚至排斥跨性別權益，甚至在許多男女同志活動中不歡迎跨性別者。一些女同志只認同生理性別與性別認同皆為女性的女同志，而一些男同志則有厭女症與恐女症因此對跨性別男性還是跨性別女性都不友善。

有高比例的跨性別女性基於職場歧視、平均教育程度低與醫療費用需求等原因從事性產業，但往往她們必須比順性別女性用更低的價格計價，或者隱藏自己的跨性別身分，也常常有跨性別妓女因為被發現其跨性別身分，而遭到言語與肢體暴力，甚至慘遭殺害。