中央研究院

1927年4月17日，中國國民黨中央政治會議第七十四次會議在南京舉行，李石曾（煜瀛）提出設立中央研究院案，決議推李石曾、蔡元培（孑民）、張人傑（靜江）共同起草中研院組織法。5月9日，中國國民黨中央政治會議第九十次會議議決設立中研院籌備處，並推定蔡元培、李煜瀛、張人傑、褚民誼、許崇清、金湘帆為籌備委員。7月4日，《中華民國大學院組織條例》公布，改列籌設中的中央研究院為中華民國大學院的附屬機關之一。11月9日，《中央研究院組織法》公布，明定「中央研究院直隸於中華民國國民政府，為中華民國最高學術研究機關」，設立：物理、化學、工程、地質、天文、氣象、歷史語言、國文學、考古學、心理學、教育、社會科學、動物、植物等十四個研究所。11月20日，大學院院長蔡元培聘請學術界人士30人在大學院召開中研院籌備會及各專門委員會聯合成立大會，討論中研院組織大綱及籌備會進行方法。議決先籌設各研究單位，計有：理化實業研究所、地質調查所、社會科學研究所、觀象台四個研究機構，並推定各所常務籌備委員，積極展開籌備工作[2]。1928年4月10日，頒布《修正國立中央研究院組織條例》，中央研究院改為不屬於大學院的獨立機關。4月23日，國民政府特任蔡元培為中央研究院院長。5月，啟用印信。6月9日，中央研究院第一次院務會議在上海東亞酒樓舉行，宣告中央研究院正式成立[2]。創辦中央研究院的主要成員是中國科學社社員，中央研究院成立後接收中國科學社在國際上作爲中國科學界官方代表的地位。

中央研究院院址設於南京雞鳴寺南側，鄰近明代南京國子監故地，包括中央研究院总办事处大楼、中央研究院历史语言研究所大楼、中央研究院地质研究所大楼三座建筑，分别修建于1947年、1936年、1931年，三座建筑均由杨廷宝设计。

蔡元培任院长的國民政府特任状

在首任院長蔡元培任內，中央研究院陸續在南京、上海等地設立十個研究所，係由理化實業研究所、社會科學研究所、歷史語言研究所、地質調查所、觀象台與自然歷史博物館演展而來。抗戰期間中央研究院曾西遷昆明、桂林、四川李庄等地，抗戰勝利後方復還京、滬。1948年3月26日，中央研究院院士選出，共81人。9月23日，第一次院士會議舉行，中研院之體制始告完成。

• 理化實業研究所於1927年11月籌設，下有物理組、化學組、工程組。1928年7月分立為物理研究所、化學研究所、工程研究所，均在上海。
• 地質調查所於1927年11月籌設，1928年7月成立地質研究所，在上海。
• 社會科學研究所於1927年11月籌設，1928年5月正式成立，下有法制組、民族組、經濟組、社會組，前兩組在南京，後兩組在上海。1934年7月，中華教育文化基金董事會之北平社會調查所併入該所，1945年改稱社會研究所。
• 觀象台於1927年11月更名，下有天文組、氣象組。1928年2月分立為天文研究所、氣象研究所，均在南京。
• 語言歷史研究所於1927年夏設於廣州中山大學，1928年3月在中山大學籌設歷史語言研究所，10月22日遷入廣州柏園正式成立，後遷北平、上海、南京。體質人類學研究所於1944年由史語所第四組中抽出另設，抗戰勝利復員後因限於經費，又由史語所收回接辦。
• 自然歷史博物館於1929年1月籌備，1930年1月成立於南京。1934年7月更名為「動植物研究所」。1944年5月分立動物研究所、植物研究所。
• 心理研究所於1928年11月決定設立，1929年1月籌備，1929年5月正式成立，在北平。
• 數學研究所於1941年籌備，1947年正式成立，在上海。
• 醫學研究所於1944年籌備。
• 近代物理（即原子能）研究所於1945年秋籌設，嗣因倉促遷台，未能完成。

1954年，經朱家驊院長多方奔走，在臺灣臺北南港現址營建院區。「植物研究所」在臺復所。1955年，成立「近代史研究所」及「民族研究所」籌備處。

1957年，多方討論出「以報到登記人數為實有全體人數」之辦法並呈奉總統令，於4月2日在台舉行第二次院士會議，4月3日舉行第三屆評議會首次會議。同年12月，胡適繼朱家驊之後擔任院長，1958年正式就職。「化學研究所」在臺復所。

以下是中研院在臺復院後的大事紀要：

• 1958年，舉行第三次院士會議。
• 1959年，舉行第四次院士會議。同年「動物研究所」在台復所。
• 1962年，舉行第五次院士會議，王世擔任院長。成立「經濟研究所」籌備處，「物理研究所」在臺復所。
• 1970年，錢思亮繼王世之後擔任院長。成立「生物化學研究所」。
• 1974年，舉行第十一次院士會議。成立「美國文化研究所」。
• 1975年，「三民主義研究所」成立。
• 1976年，成立「地球研究所」籌備處。
• 1977年，成立「資訊研究所」籌備處。
• 1978年，舉行第十三次院士會議。
• 1980年，舉行第一次國際漢學會議。
• 1981年，成立「生物醫學科學研究所」、「原子與分子科學研究所」籌備處。
• 1983年，吳大猷接任院長。
• 1986年，舉行第二次國際漢學會議。
• 1989年，成立「中國文哲研究所」籌備處。
• 1991年，ICSU在臺首次學術研討會。「美國文化研究所」更名為「歐美研究所」。
• 1993年，成立「天文研究所」、「臺灣史研究所」籌備處。
• 1994年，旅美學人李遠哲返國接任院長。「中山人文社會科學研究所」與「蔡元培人文社會科學研究中心」合併成立「人文社會科學研究中心」。
• 1995年，成立「社會學研究所」籌備處。
• 1997年，成立「語言學研究所」籌備處。
• 1998年，成立「生物農業研究所」籌備處。
• 2002年，成立「政治學研究所」籌備處。
• 2003年，成立「基因體研究中心」。
• 2004年，成立「生物多樣性研究中心」、「社會學研究所」、「法律學研究所」籌備處、。
• 2005年，由「動物研究所」改組為「細胞與個體生物學研究所」、由「植物研究所」改組為「植物暨微生物學研究所」。
• 2006年，8月「生物農業科學研究所籌備處」轉成立為「農業生物科技研究中心」。10月翁啟惠接任院長。
• 2008年，成立「南部生物技術中心」，位於臺南市南部科學園區。前身為「南部生物技術計畫中心」。
• 2010年，舉行第二十九次院士會議。

第一屆「臺灣研究世界大會」議程手冊

• 2010年6月1日，國家生技研究園區動工。
• 2012年4月，舉辦第一屆「臺灣研究世界大會」，11個所、處和中心參與籌備，共籌組二場專題演講及26個專題場次，發表102篇論文。大會邀請170位國內外學者與會發表論文、評論和主持，12國逾500學者報名。[3][4]
• 2018年5月11日，台南市歸仁區南部院區動土。

• 院長
• 院士會議
• 評議會
  • 副院長
  • 學術諮詢總會
    • 院務會議
    • 各研究所（籌備處）、研究中心學術諮詢委員會
      • 院本部
      • 研究所（籌備處）、研究中心
      • 各委員會

民族學研究所

對照1927年所通過的組織條例，列舉設有物理、化學、工程、地質、天文、氣象、歷史語言、國文學、考古學、心理學、教育、社會科學、動物、植物等十四個研究所，但部份學門創院至今仍未設所（如心理學、教育學），或是在大陸時期曾創設但仍未復所；當中多為人文社會科學學門的領域，使中研院在這方面的發展規模仍不甚完備。

數理科學組

生命科學組

人文社會科學組

圖書館系統

文物場館

其他場館

因應業務需要，中研院在院務會議之下設立各種委員會：

中央研究院從1948年開始選舉院士，目前每兩年由院士會議從全國學術界成績卓著人士中新選一批。中央研究院院士為終身名譽職，分為數理科學、生命科學及 人文社會科學三組。職權如下：選舉院士及名譽院士；選舉評議員；籌議國家學術研究方針；受政府及有關單位之委託，辦理學術設計、調查、審查及研究事項。中研院於2020年10月時有院士計278人，其中數理科學組69人、工程科學組 58人、生命科學組93人、人文及社會科學組58人。[5][6]2016年7月院士會議前有名譽院士數理科學組5人、生命科學組6人、人文及社會科學組2人；院士會議時選出2位工程科學組的名譽院士：美國國家工程學院院長克萊頓及2014年諾貝爾物理學獎得主日本教授中村修二。[7][8][6]

• 1977年9月，附近山洪暴發，中研院各館大約有一半進水，其中包括歷史語言研究所考古館，傅斯年圖書館、胡適紀念館、近代史研究所等，但損失不大。[9]
• 1984年，六三水災造成四分溪（當時尚未命名）暴漲，導致中研院院區嚴重淹水。臺北市政府因而擬以「截彎取直」方式，整治四分溪。[10]
• 2001年9月17日，納莉颱風所挾帶豪雨再次造成四分溪暴漲，中研院鄰近四分溪之七個研究所地下樓層，首當其衝，直接遭受大水侵襲，粗估此次水患硬體受損新台幣二億元左右，多年來的研究成果損失無法估計。[11]其損失項目，如地球科學研究所、生物化學研究所的昂貴儀器與稀有樣本，[12][13]以及歐美研究所圖書館的部分藏書等。[14]

• 2016年4月21日，院長翁啟惠因涉嫌對價利益輸送，而遭士林地檢署列為「貪污治罪條例」偵字案被告且限制出境。翁氏於3月請辭，5月10日批准。
• 2017年1月，士林地檢署依貪污治罪條例起訴翁啟惠。
• 2018年12月，一審獲判無罪，士林地檢署決定不上訴，無罪定讞。

• 2017年7月5日，中研院社會學研究所研究員楊文山教授主持之「2017第一次社會意向調查」問卷中，針對同性婚姻議題之題目選項，出現「直接修改民法，改變婚姻是一男一女結婚的傳統定義」及「另外訂立專法，保障同性戀伴侶的醫療、財產處理等權益」之誘導性提問，暗示修改民法將改變婚姻定義及訂立專法才能保障同性戀權益。[15]
• 上揭問卷遭網友質疑，涉嫌引用下一代幸福聯盟具誘導性提問的問題；對此，中研院社會學研究所表示，網友質疑的問題中，選項分別為「直接修改民法，破壞一夫一妻的傳統婚姻制度」及「為同性戀者訂定專法，保障同性戀者就醫跟成家的權利」，而社會意向調查問卷之措辭並不同，故沒有誘導性提問情形。[16]

2018年初中研院生化所所長陳慶士被檢舉長達十年間研究論文造假，陳在美國俄亥俄州立大學從事多年研究，期間有八篇論文被美國《科學》雜誌發現造假[17]，多處數據採樣方式與學界方法重大相異，且有蓄意詐騙跡象，美國俄亥俄州立大學之後出具70多頁調查報告[18]，建議處最重「立即撤稿」處份，案件還在知名RetractionWatch網站[19]，及國際媒體期刊大量報導，使台灣學術聲望重創，同時陳在俄大學的研究資歷是其2014年被聘回台擔任中研院生化所長的重要參照，對中研院研究水準重創。 [20]陳慶士在案發後曾向中研院學術倫理諮詢委員會提交報告，並表示數據造假是俄大學的手下學生所做與其無關，將錯誤歸咎學生。之後自行請辭中研院生化所所長，但中研院表示將研討其回台工作成果是否有該八篇論文的延伸，探討追回研究經費[21]。